Changes between Version 61 and Version 62 of Tutorial/JobSubm


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    v61 v62  
    400400=== DAG jobs (chainage de jobs) ===
    401401
    402 Un 'DAG (directed acyclic graph) job' représente un ensemble de jobs pour lesquels l'exécution d'un ou de plusieurs jobs depend de l'exécution de un ou plusieurs autres jobs. Un DAG job permet de chainer l'exécution d'un ensemble de jobs.
     402Un ''DAG (directed acyclic graph) job'' représente un ensemble de jobs pour lesquels l'exécution d'un ou de plusieurs jobs depend de l'exécution de un ou plusieurs autres jobs. Un DAG job permet de chainer l'exécution d'un ensemble de jobs.
    403403
    404404Dans le graph (DAG) les jobs (ou sub-jobs) sont les noeuds (nodes) et les arcs correspondent au dependances.
     
    406406Les attributs JDL indispensables dans le DAG job sont :
    407407
    408  * 'nodes' : permet de spécifier les différents nodes. Le nom du node est une
     408 * ''nodes'' : permet de spécifier les différents nodes. Le nom du node est une
    409409   chaine au choix (ex: nodeA, Calcul1, JobSimulation).
    410  * 'file' : permet d'indiquer le nom du fichier contenant le JDL d'un node
    411  * 'dependencies' : permet de définir les dependances entre les jobs
    412  * 'description' : permet d'écrire directement le JDL d'un node plutôt que d'utiliser l'attribut file
     410 * ''file'' : permet d'indiquer le nom du fichier contenant le JDL d'un node
     411 * ''dependencies'' : permet de définir les dependances entre les jobs
     412 * ''description'' : permet d'écrire directement le JDL d'un node plutôt que d'utiliser l'attribut file
    413413
    414414__Remarques__
    415415
    416  * La 'InputSandbox' du DAG est partagée par tous les nodes qui n'en ont pas
     416 * La ''InputSandbox'' du DAG est partagée par tous les nodes qui n'en ont pas
    417417 * Les nodes qui n'ont pas besoin de InputSandbox doivent avoir dans leur .jdl
    418418{{{
    419419  InputSandbox = {};
    420420}}}
    421  * Le .jdl du DAG job ne doit pas contenir d'attribut 'OutputSandbox'. Seul les nodes peuvent avoir cet attribut.
    422  * Un node peut accéder aux 'InputSandbox' du DAG job ainsi qu'aux 'OutputSandbox' des autres jobs terminés avant lui.
     421 * Le .jdl du DAG job ne doit pas contenir d'attribut ''OutputSandbox''. Seul les nodes peuvent avoir cet attribut.
     422 * Un node peut accéder aux ''InputSandbox'' du DAG job ainsi qu'aux ''OutputSandbox'' des autres jobs terminés avant lui.
    423423 * Pour que tous les nodes s'exectuent sur le même CE, mettre dans le .jdl.
    424424{{{
     
    465465}}}
    466466
    467 'file' précise le fichier contenant le JDL de chaque node. Examinons les JDL des nodes.
     467L'attribut ''file'' précise le fichier contenant le JDL de chaque node. Examinons les JDL des nodes.
    468468
    469469__JDL de nodeA__
     
    487487}}}
    488488
    489 nodeA a sa propre 'InputSandbox' mais peut inclure en plus la 'InputSandbox'
    490 du DAG via la variable 'root.InputSandbox'. Ainsi il peut accéder ici par
    491 exemple au fichier DAGInput.txt compris dans la 'InputSandbox' du DAG job.
     489nodeA a sa propre ''InputSandbox'' mais peut inclure en plus la ''InputSandbox''
     490du DAG via la variable ''root.InputSandbox''. Ainsi il peut accéder ici par
     491exemple au fichier DAGInput.txt compris dans la ''InputSandbox'' du DAG job.
    492492
    493493__JDL de nodeB__
     
    510510}}}
    511511
    512 On voit que nodeB peut accéder au fichier de sortie de nodeA via root.nodes.nodeA.description.OutputSandbox[2] qui est le 3ème fichier de la OutputSandbox du JDL (description) de nodeA du DAG (root);
    513 
    514 Dans les fichiers exécutables ('Executable'), il suffit de récupérer les arguments ('Arguments') et de faire le traitement souhaité.
     512On voit que nodeB peut accéder au fichier de sortie de nodeA via ''root.nodes.nodeA.description.OutputSandbox[2]'' qui est le 3ème fichier de la OutputSandbox du JDL (description) de nodeA du DAG (root);
     513
     514Dans les fichiers exécutables (''Executable''), il suffit de récupérer les arguments (''Arguments'') et de faire le traitement souhaité.
    515515
    516516La soumission d'un DAG job se fait comme pour un job normal. On obtient un <dagID> qui permet de controler le dag.
     
    591591
    592592}}}
    593 
    594 
    595 
    596 
    597 
    598593
    599594=== Examen en temps réel des fichiers de sortie : Job Perusal ===