| 1 | #include <stdlib.h>
|
|---|
| 2 | #include <string.h>
|
|---|
| 3 | #include "minifits.h"
|
|---|
| 4 |
|
|---|
| 5 | // #include <iostream>
|
|---|
| 6 |
|
|---|
| 7 | //////////////////////////////////////////////////////////////////////
|
|---|
| 8 | /// Classe MiniFITSException
|
|---|
| 9 | //////////////////////////////////////////////////////////////////////
|
|---|
| 10 |
|
|---|
| 11 |
|
|---|
| 12 | /* --Methode-- */
|
|---|
| 13 | MiniFITSException::MiniFITSException(const char * m) throw()
|
|---|
| 14 | {
|
|---|
| 15 | if (m!=NULL) {
|
|---|
| 16 | strncpy(msg_, m, MFEX_MAXMSGLEN-1);
|
|---|
| 17 | msg_[MFEX_MAXMSGLEN-1] = '\0';
|
|---|
| 18 | }
|
|---|
| 19 | else msg_[0] = '\0';
|
|---|
| 20 | }
|
|---|
| 21 |
|
|---|
| 22 | /* --Methode-- */
|
|---|
| 23 | MiniFITSException::MiniFITSException(const string& m) throw()
|
|---|
| 24 | {
|
|---|
| 25 | strncpy(msg_, m.c_str(), MFEX_MAXMSGLEN-1);
|
|---|
| 26 | msg_[MFEX_MAXMSGLEN-1] = '\0';
|
|---|
| 27 | }
|
|---|
| 28 |
|
|---|
| 29 | /* --Methode-- */
|
|---|
| 30 | MiniFITSException::~MiniFITSException() throw()
|
|---|
| 31 | {
|
|---|
| 32 | }
|
|---|
| 33 |
|
|---|
| 34 | /* --Methode-- */
|
|---|
| 35 | const char* MiniFITSException::what() const throw()
|
|---|
| 36 | {
|
|---|
| 37 | return msg_;
|
|---|
| 38 | }
|
|---|
| 39 |
|
|---|
| 40 | /* --Methode-- */
|
|---|
| 41 | string const MiniFITSException::Msg() const
|
|---|
| 42 | {
|
|---|
| 43 | return (string(msg_));
|
|---|
| 44 | }
|
|---|
| 45 |
|
|---|
| 46 | //////////////////////////////////////////////////////////////////////
|
|---|
| 47 | /// Classe MiniFITSFile
|
|---|
| 48 | //////////////////////////////////////////////////////////////////////
|
|---|
| 49 |
|
|---|
| 50 | #define MFITSHLEN 2880
|
|---|
| 51 |
|
|---|
| 52 | /* --Methode-- */
|
|---|
| 53 | MiniFITSFile::MiniFITSFile()
|
|---|
| 54 | {
|
|---|
| 55 | Init();
|
|---|
| 56 | }
|
|---|
| 57 |
|
|---|
| 58 | /* --Methode-- */
|
|---|
| 59 | MiniFITSFile::MiniFITSFile(string const & nom, MiniFITS_Mode rwm)
|
|---|
| 60 | {
|
|---|
| 61 | Init();
|
|---|
| 62 | Open(nom, rwm);
|
|---|
| 63 | }
|
|---|
| 64 |
|
|---|
| 65 | /* --Methode-- */
|
|---|
| 66 | MiniFITSFile::MiniFITSFile(const char* nom, MiniFITS_Mode rwm)
|
|---|
| 67 | {
|
|---|
| 68 | Init();
|
|---|
| 69 | Open(nom, rwm);
|
|---|
| 70 | }
|
|---|
| 71 |
|
|---|
| 72 |
|
|---|
| 73 | /* --Methode-- */
|
|---|
| 74 | MiniFITSFile::~MiniFITSFile()
|
|---|
| 75 | {
|
|---|
| 76 | Close();
|
|---|
| 77 | delete[] header;
|
|---|
| 78 | }
|
|---|
| 79 |
|
|---|
| 80 | /* --Methode-- */
|
|---|
| 81 | void MiniFITSFile::Init()
|
|---|
| 82 | {
|
|---|
| 83 | fip = NULL;
|
|---|
| 84 | rwmode = MF_Read;
|
|---|
| 85 | dtype = MF_Byte;
|
|---|
| 86 | nax1 = 1;
|
|---|
| 87 | nax2 = 1;
|
|---|
| 88 | nax3 = 1;
|
|---|
| 89 | fgnax3 = false;
|
|---|
| 90 | totwsz = 0;
|
|---|
| 91 | header = new char[MFITSHLEN];
|
|---|
| 92 | for(int i=0; i<MFITSHLEN; i++) header[i]=' ';
|
|---|
| 93 | nkeya_ = 0;
|
|---|
| 94 | }
|
|---|
| 95 |
|
|---|
| 96 | /* --Methode-- */
|
|---|
| 97 | void MiniFITSFile::Open(const char* nom, MiniFITS_Mode rwm)
|
|---|
| 98 | {
|
|---|
| 99 | if (fip != NULL) throw MiniFITSException("MiniFITSFile::Open() - fip != NULL");
|
|---|
| 100 | if (rwm == MF_Write) {
|
|---|
| 101 | for(int i=0; i<MFITSHLEN; i++) header[i]=' ';
|
|---|
| 102 | nkeya_ = 0;
|
|---|
| 103 | FillHeader();
|
|---|
| 104 | fip = fopen(nom, "w");
|
|---|
| 105 | if (fip == NULL)
|
|---|
| 106 | throw MiniFITSException("MiniFITSFile::Open()/ failed fopen() for write");
|
|---|
| 107 | fwrite(header, 1, MFITSHLEN, fip);
|
|---|
| 108 | rwmode = MF_Write;
|
|---|
| 109 | }
|
|---|
| 110 | else {
|
|---|
| 111 | fip = fopen(nom, "r");
|
|---|
| 112 | if (fip == NULL)
|
|---|
| 113 | throw MiniFITSException("MiniFITSFile::Open()/ failed fopen() for read");
|
|---|
| 114 | fread(header, 1, MFITSHLEN, fip);
|
|---|
| 115 | DecodeHeader();
|
|---|
| 116 | rwmode = MF_Read;
|
|---|
| 117 | }
|
|---|
| 118 | return;
|
|---|
| 119 | }
|
|---|
| 120 |
|
|---|
| 121 | /* --Methode-- */
|
|---|
| 122 | void MiniFITSFile::Close()
|
|---|
| 123 | {
|
|---|
| 124 | if (fip) {
|
|---|
| 125 | if (rwmode == MF_Write) {
|
|---|
| 126 | // on remplit avec des zeros pour avoir une longueur multiple de 2880
|
|---|
| 127 | size_t padsz = MFITSHLEN-(totwsz%MFITSHLEN);
|
|---|
| 128 | char zeros[160];
|
|---|
| 129 | for(size_t k=0; k<160; k++) zeros[k]=0;
|
|---|
| 130 | while(padsz>160) {
|
|---|
| 131 | fwrite(zeros, 1, 160, fip);
|
|---|
| 132 | padsz-=160;
|
|---|
| 133 | }
|
|---|
| 134 | if (padsz>0) fwrite(zeros, 1, padsz, fip);
|
|---|
| 135 | // On reecrit l'entete
|
|---|
| 136 | FillHeader();
|
|---|
| 137 | fseek(fip, 0, SEEK_SET);
|
|---|
| 138 | fwrite(header, 1, MFITSHLEN, fip);
|
|---|
| 139 | }
|
|---|
| 140 | fclose(fip);
|
|---|
| 141 | }
|
|---|
| 142 | fip = NULL;
|
|---|
| 143 | return;
|
|---|
| 144 | }
|
|---|
| 145 |
|
|---|
| 146 | /* --Methode-- */
|
|---|
| 147 | void MiniFITSFile::setDTypeNaxis(MiniFITS_DT dt, size_t na1, size_t na2)
|
|---|
| 148 | {
|
|---|
| 149 | // Interdit si fichier ouvert en lecture ...
|
|---|
| 150 | if ((fip!=NULL)&&(rwmode == MF_Read))
|
|---|
| 151 | throw MiniFITSException("MiniFITSFile::setDTypeNaxis()/Error ReadOnly file");
|
|---|
| 152 |
|
|---|
| 153 | dtype = dt;
|
|---|
| 154 | nax1 = na1;
|
|---|
| 155 | nax2 = na2;
|
|---|
| 156 | nax3 = 1;
|
|---|
| 157 | fgnax3 = false;
|
|---|
| 158 | }
|
|---|
| 159 |
|
|---|
| 160 | /* --Methode-- */
|
|---|
| 161 | void MiniFITSFile::setDTypeNaxis(MiniFITS_DT dt, size_t na1, size_t na2, size_t na3)
|
|---|
| 162 | {
|
|---|
| 163 | // Interdit si fichier ouvert en lecture ...
|
|---|
| 164 | if ((fip!=NULL)&&(rwmode == MF_Read))
|
|---|
| 165 | throw MiniFITSException("MiniFITSFile::setDTypeNaxis()/Error ReadOnly file");
|
|---|
| 166 |
|
|---|
| 167 | dtype = dt;
|
|---|
| 168 | nax1 = na1;
|
|---|
| 169 | nax2 = na2;
|
|---|
| 170 | nax3 = na3;
|
|---|
| 171 | fgnax3 = true;
|
|---|
| 172 | }
|
|---|
| 173 |
|
|---|
| 174 |
|
|---|
| 175 | /* --Methode-- */
|
|---|
| 176 | string MiniFITSFile::DataTypeToString()
|
|---|
| 177 | {
|
|---|
| 178 | if (dtype == MF_Byte) return "MF_Byte";
|
|---|
| 179 | else if (dtype == MF_Int16) return "MF_Int16";
|
|---|
| 180 | else if (dtype == MF_Float32) return "MF_Float32";
|
|---|
| 181 | else return "Unknown??";
|
|---|
| 182 | }
|
|---|
| 183 |
|
|---|
| 184 | /* --Methode-- */
|
|---|
| 185 | int MiniFITSFile::Write(void* data, size_t sz)
|
|---|
| 186 | {
|
|---|
| 187 | fwrite(data, 1, sz, fip);
|
|---|
| 188 | totwsz += sz;
|
|---|
| 189 | return 0;
|
|---|
| 190 | }
|
|---|
| 191 |
|
|---|
| 192 | /* --Methode-- */
|
|---|
| 193 | int MiniFITSFile::Read(void* data, size_t sz, size_t offset)
|
|---|
| 194 | {
|
|---|
| 195 | fseek(fip, offset+MFITSHLEN, SEEK_SET);
|
|---|
| 196 | fread(data, 1, sz, fip);
|
|---|
| 197 | return 0;
|
|---|
| 198 | }
|
|---|
| 199 |
|
|---|
| 200 | /* --Methode-- */
|
|---|
| 201 | void MiniFITSFile::FillHeader()
|
|---|
| 202 | {
|
|---|
| 203 | strcpy(header, "SIMPLE = T / file does conform to FITS standard");
|
|---|
| 204 | header[strlen(header)] = ' ';
|
|---|
| 205 | int bpix = 8;
|
|---|
| 206 | if (dtype == MF_Byte) bpix = 8;
|
|---|
| 207 | else if (dtype == MF_Int16) bpix = 16;
|
|---|
| 208 | else if (dtype == MF_Float32) bpix = -32;
|
|---|
| 209 | char * buff = header+80;
|
|---|
| 210 | sprintf(buff, "BITPIX = %20d / number of bits per data pixel", bpix);
|
|---|
| 211 | buff[strlen(buff)] = ' ';
|
|---|
| 212 | buff = header+160;
|
|---|
| 213 | if (fgnax3)
|
|---|
| 214 | strcpy(buff, "NAXIS = 3 / number of data axes");
|
|---|
| 215 | else
|
|---|
| 216 | strcpy(buff, "NAXIS = 2 / number of data axes");
|
|---|
| 217 | buff[strlen(buff)] = ' ';
|
|---|
| 218 | buff = header+240;
|
|---|
| 219 | sprintf(buff, "NAXIS1 = %20ld / nb of pixels along X = PaquetSize", (long)nax1);
|
|---|
| 220 | buff[strlen(buff)] = ' ';
|
|---|
| 221 | buff = header+320;
|
|---|
| 222 | if (fgnax3)
|
|---|
| 223 | sprintf(buff, "NAXIS2 = %20ld / Number of fibers ", (long)nax2);
|
|---|
| 224 | else
|
|---|
| 225 | sprintf(buff, "NAXIS2 = %20ld / NumberOfPaquets", (long)nax2);
|
|---|
| 226 | buff[strlen(buff)] = ' ';
|
|---|
| 227 | buff = header+400;
|
|---|
| 228 | if (fgnax3)
|
|---|
| 229 | sprintf(buff, "NAXIS3 = %20ld / Number of paquets ", (long)nax3);
|
|---|
| 230 | else
|
|---|
| 231 | strcpy(buff,"COMMENT BAO-Radio / MiniFITSFile ");
|
|---|
| 232 | buff[strlen(buff)] = ' ';
|
|---|
| 233 |
|
|---|
| 234 | buff = header+480+nkeya_*80;
|
|---|
| 235 | strcpy(buff,"COMMENT BAO-Radio / MiniFITSFile ");
|
|---|
| 236 | buff[strlen(buff)] = ' ';
|
|---|
| 237 | buff = header+560+nkeya_*80;
|
|---|
| 238 | strcpy(buff,"END");
|
|---|
| 239 | buff[strlen(buff)] = ' ';
|
|---|
| 240 |
|
|---|
| 241 | return;
|
|---|
| 242 | }
|
|---|
| 243 |
|
|---|
| 244 | /* --Methode-- */
|
|---|
| 245 | int MiniFITSFile::AddKeyI(const char* key, long val, const char* comm)
|
|---|
| 246 | {
|
|---|
| 247 | if (nkeya_ >= 28) return 0;
|
|---|
| 248 | char cle[10];
|
|---|
| 249 | strncpy(cle,key,8);
|
|---|
| 250 | cle[8]='=';
|
|---|
| 251 | for(int i=0;i<8;i++)
|
|---|
| 252 | if (cle[i]=='\0') cle[i]=' ';
|
|---|
| 253 | cle[9]='\0';
|
|---|
| 254 | char* buff=header+480+nkeya_*80;
|
|---|
| 255 | if (comm!=NULL) {
|
|---|
| 256 | char tcom[50];
|
|---|
| 257 | strncpy(tcom,comm,48);
|
|---|
| 258 | tcom[48]='\0';
|
|---|
| 259 | sprintf(buff,"%s %20ld / %s", cle, val, tcom);
|
|---|
| 260 | }
|
|---|
| 261 | else sprintf(buff,"%s %20ld / ", cle, val);
|
|---|
| 262 | buff[strlen(buff)]=' ';
|
|---|
| 263 | nkeya_++;
|
|---|
| 264 | return nkeya_;
|
|---|
| 265 | }
|
|---|
| 266 |
|
|---|
| 267 | /* --Methode-- */
|
|---|
| 268 | int MiniFITSFile::AddKeyD(const char* key, double val, const char* comm)
|
|---|
| 269 | {
|
|---|
| 270 | if (nkeya_ >= 28) return 0;
|
|---|
| 271 | char cle[10];
|
|---|
| 272 | strncpy(cle,key,8);
|
|---|
| 273 | cle[8]='=';
|
|---|
| 274 | for(int i=0;i<8;i++)
|
|---|
| 275 | if (cle[i]=='\0') cle[i]=' ';
|
|---|
| 276 | cle[9]='\0';
|
|---|
| 277 | char* buff=header+480+nkeya_*80;
|
|---|
| 278 | if (comm!=NULL) {
|
|---|
| 279 | char tcom[50];
|
|---|
| 280 | strncpy(tcom,comm,48);
|
|---|
| 281 | tcom[48]='\0';
|
|---|
| 282 | sprintf(buff,"%s %20lg / %s", cle, val, tcom);
|
|---|
| 283 | }
|
|---|
| 284 | else sprintf(buff,"%s %20lg / ", cle, val);
|
|---|
| 285 | buff[strlen(buff)] = ' ';
|
|---|
| 286 | nkeya_++;
|
|---|
| 287 | return nkeya_;
|
|---|
| 288 | }
|
|---|
| 289 |
|
|---|
| 290 | /* --Methode-- */
|
|---|
| 291 | int MiniFITSFile::AddKeyS(const char* key, const char* val, const char* comm)
|
|---|
| 292 | {
|
|---|
| 293 | if (nkeya_ >= 28) return 0;
|
|---|
| 294 | char cle[10];
|
|---|
| 295 | strncpy(cle,key,8);
|
|---|
| 296 | cle[8]='=';
|
|---|
| 297 | for(int i=0;i<8;i++)
|
|---|
| 298 | if (cle[i]=='\0') cle[i]=' ';
|
|---|
| 299 | cle[9]='\0';
|
|---|
| 300 | char tcom[72];
|
|---|
| 301 | tcom[0]='\'';
|
|---|
| 302 | strncpy(tcom+1,val,65);
|
|---|
| 303 | int l=strlen(tcom);
|
|---|
| 304 | strcpy(tcom+l,"' / ");
|
|---|
| 305 | l+=4;
|
|---|
| 306 | if ((l<70)&&(comm!=NULL)) strncpy(tcom+l,comm,70-l);
|
|---|
| 307 | tcom[70]='\0';
|
|---|
| 308 | char* buff=header+480+nkeya_*80;
|
|---|
| 309 | sprintf(buff,"%s %s", cle, tcom);
|
|---|
| 310 | buff[strlen(buff)] = ' ';
|
|---|
| 311 | nkeya_++;
|
|---|
| 312 | return nkeya_;
|
|---|
| 313 | }
|
|---|
| 314 |
|
|---|
| 315 | /* --Methode-- */
|
|---|
| 316 | string MiniFITSFile::GetKey(const char* key)
|
|---|
| 317 | {
|
|---|
| 318 | char rs[80];
|
|---|
| 319 | rs[0]='\0';
|
|---|
| 320 | char cle[10];
|
|---|
| 321 | strncpy(cle,key,8);
|
|---|
| 322 | cle[8]='=';
|
|---|
| 323 | for(int i=0;i<8;i++)
|
|---|
| 324 | if (cle[i]=='\0') cle[i]=' ';
|
|---|
| 325 | cle[9]='\0';
|
|---|
| 326 | for(int kh=80; kh<2800; kh+=80) {
|
|---|
| 327 | char * buff = header+kh;
|
|---|
| 328 | if (strncmp(buff, cle, 9) == 0) {
|
|---|
| 329 | strncpy(rs, buff, 79);
|
|---|
| 330 | rs[79]='\0';
|
|---|
| 331 | break;
|
|---|
| 332 | }
|
|---|
| 333 | }
|
|---|
| 334 | return rs;
|
|---|
| 335 | }
|
|---|
| 336 |
|
|---|
| 337 | /* --Methode-- */
|
|---|
| 338 | string MiniFITSFile::GetKeyValue(const char* key)
|
|---|
| 339 | {
|
|---|
| 340 | string line = GetKey(key);
|
|---|
| 341 | if(line.size()==0) return "";
|
|---|
| 342 | char rs[84], sep = '?';
|
|---|
| 343 | bool foundeq = false;
|
|---|
| 344 | unsigned int ip = 0;
|
|---|
| 345 | for(unsigned int i=0;i<line.size();i++) {
|
|---|
| 346 | if(!foundeq) {if(line[i] == '=') foundeq = true; continue;}
|
|---|
| 347 | if(sep=='?') { // recherche du separateur de debut
|
|---|
| 348 | if(line[i]==' ') continue;
|
|---|
| 349 | if(line[i]=='\'' || line[i]=='\"') {sep = line[i]; continue;}
|
|---|
| 350 | else sep = ' ';
|
|---|
| 351 | }
|
|---|
| 352 | if(line[i]==sep) break;
|
|---|
| 353 | rs[ip] = line[i];
|
|---|
| 354 | ip++;
|
|---|
| 355 | }
|
|---|
| 356 | rs[ip] = '\0';
|
|---|
| 357 | return rs;
|
|---|
| 358 | }
|
|---|
| 359 |
|
|---|
| 360 | /* --Methode-- */
|
|---|
| 361 | void MiniFITSFile::DecodeHeader()
|
|---|
| 362 | {
|
|---|
| 363 | // AMELIORER le decodage de l'entete, remplissage dtype, nax1, nax2
|
|---|
| 364 | char * buff = header;
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| 365 | if (strncmp(buff, "SIMPLE =", 9) != 0)
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| 366 | throw MiniFITSException("MiniFITSFile::DecodeHeader()/Error - NO SIMPLE keyword");
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| 367 | bool fgokt=false;
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|---|
| 368 | bool fgok1=false;
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|---|
| 369 | bool fgok2=false;
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| 370 | bool fgok3=false;
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|---|
| 371 | for(int kh=80; kh<2800; kh+=80) {
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| 372 | buff = header+kh;
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| 373 | if (strncmp(buff, "NAXIS1 =", 9) == 0) {
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|---|
| 374 | nax1 = atol(buff+10);
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|---|
| 375 | fgok1 = true;
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|---|
| 376 | // cout << " FOUND : NAXIS1= " << nax1 << endl;
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|---|
| 377 | }
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|---|
| 378 | else if (strncmp(buff, "NAXIS2 =", 9) == 0) {
|
|---|
| 379 | nax2 = atol(buff+10);
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|---|
| 380 | fgok2 = true;
|
|---|
| 381 | // cout << " FOUND : NAXIS2= " << nax2 << endl;
|
|---|
| 382 | }
|
|---|
| 383 | else if (strncmp(buff, "NAXIS3 =", 9) == 0) {
|
|---|
| 384 | nax3 = atol(buff+10);
|
|---|
| 385 | fgok3 = true;
|
|---|
| 386 | // cout << " FOUND : NAXIS2= " << nax2 << endl;
|
|---|
| 387 | }
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|---|
| 388 | else if (strncmp(buff, "BITPIX =", 9) == 0) {
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| 389 | int bpix = atoi(buff+10);
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| 390 | fgokt = true;
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| 391 | if (bpix == 8) dtype = MF_Byte;
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|---|
| 392 | else if (bpix == 16) dtype = MF_Int16;
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|---|
| 393 | else if (bpix == -32) dtype = MF_Float32;
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|---|
| 394 | else fgokt = false;
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|---|
| 395 | // cout << " FOUND : bpix= " << bpix << endl;
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|---|
| 396 | }
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|---|
| 397 | }
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|---|
| 398 | if (!(fgok1&&fgok2&&fgokt))
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|---|
| 399 | throw MiniFITSException("MiniFITSFile::DecodeHeader()/Error- Missing/wrong NAXIS1/2,BITPIX");
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|---|
| 400 | if (fgok3) fgnax3=true;
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|---|
| 401 | return;
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| 402 | }
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| 403 |
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