| 1 | #include <stdlib.h> | 
|---|
| 2 | #include <string.h> | 
|---|
| 3 | #include "minifits.h" | 
|---|
| 4 |  | 
|---|
| 5 | // #include <iostream> | 
|---|
| 6 |  | 
|---|
| 7 | ////////////////////////////////////////////////////////////////////// | 
|---|
| 8 | //     Classe  MiniFITSException | 
|---|
| 9 | ////////////////////////////////////////////////////////////////////// | 
|---|
| 10 | /*! | 
|---|
| 11 | \class MiniFITSException | 
|---|
| 12 | \ingroup TAcq | 
|---|
| 13 |  | 
|---|
| 14 | \brief Exception class for FITS I/O services provided by the MiniFITSFile class. | 
|---|
| 15 | */ | 
|---|
| 16 |  | 
|---|
| 17 |  | 
|---|
| 18 | /* --Methode-- */ | 
|---|
| 19 | MiniFITSException::MiniFITSException(const char * m)   throw() | 
|---|
| 20 | { | 
|---|
| 21 | if (m!=NULL) { | 
|---|
| 22 | strncpy(msg_, m, MFEX_MAXMSGLEN-1); | 
|---|
| 23 | msg_[MFEX_MAXMSGLEN-1] = '\0'; | 
|---|
| 24 | } | 
|---|
| 25 | else msg_[0] = '\0'; | 
|---|
| 26 | } | 
|---|
| 27 |  | 
|---|
| 28 | /* --Methode-- */ | 
|---|
| 29 | MiniFITSException::MiniFITSException(const string& m)   throw() | 
|---|
| 30 | { | 
|---|
| 31 | strncpy(msg_, m.c_str(), MFEX_MAXMSGLEN-1); | 
|---|
| 32 | msg_[MFEX_MAXMSGLEN-1] = '\0'; | 
|---|
| 33 | } | 
|---|
| 34 |  | 
|---|
| 35 | /* --Methode-- */ | 
|---|
| 36 | MiniFITSException::~MiniFITSException()  throw() | 
|---|
| 37 | { | 
|---|
| 38 | } | 
|---|
| 39 |  | 
|---|
| 40 | /* --Methode-- */ | 
|---|
| 41 | const char* MiniFITSException::what() const throw() | 
|---|
| 42 | { | 
|---|
| 43 | return msg_; | 
|---|
| 44 | } | 
|---|
| 45 |  | 
|---|
| 46 | /* --Methode-- */ | 
|---|
| 47 | string const MiniFITSException::Msg() const | 
|---|
| 48 | { | 
|---|
| 49 | return (string(msg_)); | 
|---|
| 50 | } | 
|---|
| 51 |  | 
|---|
| 52 | ////////////////////////////////////////////////////////////////////// | 
|---|
| 53 | //     Classe  MiniFITSFile | 
|---|
| 54 | ////////////////////////////////////////////////////////////////////// | 
|---|
| 55 | /*! | 
|---|
| 56 | \class MiniFITSFile | 
|---|
| 57 | \ingroup TAcq | 
|---|
| 58 |  | 
|---|
| 59 | \brief This class provides a subset of I/O services in FITS format (IMAGE_HDU only). | 
|---|
| 60 | */ | 
|---|
| 61 |  | 
|---|
| 62 | #define MFITSHLEN 2880 | 
|---|
| 63 |  | 
|---|
| 64 | /* --Methode-- */ | 
|---|
| 65 | MiniFITSFile::MiniFITSFile() | 
|---|
| 66 | { | 
|---|
| 67 | Init(); | 
|---|
| 68 | } | 
|---|
| 69 |  | 
|---|
| 70 | /* --Methode-- */ | 
|---|
| 71 | MiniFITSFile::MiniFITSFile(string const & nom, MiniFITS_Mode rwm) | 
|---|
| 72 | { | 
|---|
| 73 | Init(); | 
|---|
| 74 | Open(nom, rwm); | 
|---|
| 75 | } | 
|---|
| 76 |  | 
|---|
| 77 | /* --Methode-- */ | 
|---|
| 78 | MiniFITSFile::MiniFITSFile(const char* nom, MiniFITS_Mode rwm) | 
|---|
| 79 | { | 
|---|
| 80 | Init(); | 
|---|
| 81 | Open(nom, rwm); | 
|---|
| 82 | } | 
|---|
| 83 |  | 
|---|
| 84 |  | 
|---|
| 85 | /* --Methode-- */ | 
|---|
| 86 | MiniFITSFile::~MiniFITSFile() | 
|---|
| 87 | { | 
|---|
| 88 | Close(); | 
|---|
| 89 | delete[] header; | 
|---|
| 90 | } | 
|---|
| 91 |  | 
|---|
| 92 | /* --Methode-- */ | 
|---|
| 93 | void MiniFITSFile::Init() | 
|---|
| 94 | { | 
|---|
| 95 | fip = NULL; | 
|---|
| 96 | rwmode = MF_Read; | 
|---|
| 97 | dtype = MF_Byte; | 
|---|
| 98 | nax1 = 1; | 
|---|
| 99 | nax2 = 1; | 
|---|
| 100 | nax3 = 1; | 
|---|
| 101 | fgnax3 = false; | 
|---|
| 102 | totwsz = 0; | 
|---|
| 103 | header = new char[MFITSHLEN]; | 
|---|
| 104 | for(int i=0; i<MFITSHLEN; i++)  header[i]=' '; | 
|---|
| 105 | nkeya_ = 0; | 
|---|
| 106 | } | 
|---|
| 107 |  | 
|---|
| 108 | /* --Methode-- */ | 
|---|
| 109 | void MiniFITSFile::Open(const char* nom, MiniFITS_Mode rwm) | 
|---|
| 110 | { | 
|---|
| 111 | if (fip != NULL) throw MiniFITSException("MiniFITSFile::Open() - fip != NULL"); | 
|---|
| 112 | if (rwm == MF_Write) { | 
|---|
| 113 | for(int i=0; i<MFITSHLEN; i++)  header[i]=' '; | 
|---|
| 114 | nkeya_ = 0; | 
|---|
| 115 | FillHeader(); | 
|---|
| 116 | fip = fopen(nom, "w"); | 
|---|
| 117 | if (fip == NULL) | 
|---|
| 118 | throw MiniFITSException("MiniFITSFile::Open()/ failed fopen() for write"); | 
|---|
| 119 | fwrite(header, 1, MFITSHLEN, fip); | 
|---|
| 120 | rwmode = MF_Write; | 
|---|
| 121 | } | 
|---|
| 122 | else { | 
|---|
| 123 | fip = fopen(nom, "r"); | 
|---|
| 124 | if (fip == NULL) | 
|---|
| 125 | throw MiniFITSException("MiniFITSFile::Open()/ failed fopen() for read"); | 
|---|
| 126 | fread(header, 1, MFITSHLEN, fip); | 
|---|
| 127 | DecodeHeader(); | 
|---|
| 128 | rwmode = MF_Read; | 
|---|
| 129 | } | 
|---|
| 130 | return; | 
|---|
| 131 | } | 
|---|
| 132 |  | 
|---|
| 133 | /* --Methode-- */ | 
|---|
| 134 | void MiniFITSFile::Close() | 
|---|
| 135 | { | 
|---|
| 136 | if (fip) { | 
|---|
| 137 | if (rwmode == MF_Write)  { | 
|---|
| 138 | // on remplit avec des zeros pour avoir une longueur multiple de 2880 | 
|---|
| 139 | size_t padsz = MFITSHLEN-(totwsz%MFITSHLEN); | 
|---|
| 140 | char zeros[160]; | 
|---|
| 141 | for(size_t k=0; k<160; k++) zeros[k]=0; | 
|---|
| 142 | while(padsz>160) { | 
|---|
| 143 | fwrite(zeros, 1, 160, fip); | 
|---|
| 144 | padsz-=160; | 
|---|
| 145 | } | 
|---|
| 146 | if (padsz>0)  fwrite(zeros, 1, padsz, fip); | 
|---|
| 147 | // On reecrit l'entete | 
|---|
| 148 | FillHeader(); | 
|---|
| 149 | fseek(fip, 0, SEEK_SET); | 
|---|
| 150 | fwrite(header, 1, MFITSHLEN, fip); | 
|---|
| 151 | } | 
|---|
| 152 | fclose(fip); | 
|---|
| 153 | } | 
|---|
| 154 | fip = NULL; | 
|---|
| 155 | return; | 
|---|
| 156 | } | 
|---|
| 157 |  | 
|---|
| 158 | /* --Methode-- */ | 
|---|
| 159 | void MiniFITSFile::setDTypeNaxis(MiniFITS_DT dt, size_t na1, size_t na2) | 
|---|
| 160 | { | 
|---|
| 161 | // Interdit si fichier ouvert en lecture ... | 
|---|
| 162 | if ((fip!=NULL)&&(rwmode == MF_Read)) | 
|---|
| 163 | throw MiniFITSException("MiniFITSFile::setDTypeNaxis()/Error ReadOnly file"); | 
|---|
| 164 |  | 
|---|
| 165 | dtype = dt; | 
|---|
| 166 | nax1 = na1; | 
|---|
| 167 | nax2 = na2; | 
|---|
| 168 | nax3 = 1; | 
|---|
| 169 | fgnax3 = false; | 
|---|
| 170 | } | 
|---|
| 171 |  | 
|---|
| 172 | /* --Methode-- */ | 
|---|
| 173 | void MiniFITSFile::setDTypeNaxis(MiniFITS_DT dt, size_t na1, size_t na2, size_t na3) | 
|---|
| 174 | { | 
|---|
| 175 | // Interdit si fichier ouvert en lecture ... | 
|---|
| 176 | if ((fip!=NULL)&&(rwmode == MF_Read)) | 
|---|
| 177 | throw MiniFITSException("MiniFITSFile::setDTypeNaxis()/Error ReadOnly file"); | 
|---|
| 178 |  | 
|---|
| 179 | dtype = dt; | 
|---|
| 180 | nax1 = na1; | 
|---|
| 181 | nax2 = na2; | 
|---|
| 182 | nax3 = na3; | 
|---|
| 183 | fgnax3 = true; | 
|---|
| 184 | } | 
|---|
| 185 |  | 
|---|
| 186 |  | 
|---|
| 187 | /* --Methode-- */ | 
|---|
| 188 | string MiniFITSFile::DataTypeToString() | 
|---|
| 189 | { | 
|---|
| 190 | if (dtype == MF_Byte) return "MF_Byte"; | 
|---|
| 191 | else if (dtype == MF_Int16) return "MF_Int16"; | 
|---|
| 192 | else if (dtype == MF_Float32) return "MF_Float32"; | 
|---|
| 193 | else return "Unknown??"; | 
|---|
| 194 | } | 
|---|
| 195 |  | 
|---|
| 196 | /* --Methode-- */ | 
|---|
| 197 | int MiniFITSFile::Write(void* data, size_t sz) | 
|---|
| 198 | { | 
|---|
| 199 | fwrite(data, 1, sz, fip); | 
|---|
| 200 | totwsz += sz; | 
|---|
| 201 | return 0; | 
|---|
| 202 | } | 
|---|
| 203 |  | 
|---|
| 204 | /* --Methode-- */ | 
|---|
| 205 | int MiniFITSFile::Read(void* data, size_t sz, size_t offset) | 
|---|
| 206 | { | 
|---|
| 207 | fseek(fip, offset+MFITSHLEN, SEEK_SET); | 
|---|
| 208 | fread(data, 1, sz, fip); | 
|---|
| 209 | return 0; | 
|---|
| 210 | } | 
|---|
| 211 |  | 
|---|
| 212 | /* --Methode-- */ | 
|---|
| 213 | void MiniFITSFile::FillHeader() | 
|---|
| 214 | { | 
|---|
| 215 | strcpy(header, "SIMPLE  =                    T / file does conform to FITS standard"); | 
|---|
| 216 | header[strlen(header)] = ' '; | 
|---|
| 217 | int bpix = 8; | 
|---|
| 218 | if (dtype == MF_Byte) bpix = 8; | 
|---|
| 219 | else if (dtype == MF_Int16) bpix = 16; | 
|---|
| 220 | else if (dtype == MF_Float32) bpix = -32; | 
|---|
| 221 | char * buff = header+80; | 
|---|
| 222 | sprintf(buff, "BITPIX  = %20d / number of bits per data pixel", bpix); | 
|---|
| 223 | buff[strlen(buff)] = ' '; | 
|---|
| 224 | buff = header+160; | 
|---|
| 225 | if (fgnax3) | 
|---|
| 226 | strcpy(buff, "NAXIS   =                    3 / number of data axes"); | 
|---|
| 227 | else | 
|---|
| 228 | strcpy(buff, "NAXIS   =                    2 / number of data axes"); | 
|---|
| 229 | buff[strlen(buff)] = ' '; | 
|---|
| 230 | buff = header+240; | 
|---|
| 231 | sprintf(buff, "NAXIS1  = %20ld / nb of pixels along X = PaquetSize", (long)nax1); | 
|---|
| 232 | buff[strlen(buff)] = ' '; | 
|---|
| 233 | buff = header+320; | 
|---|
| 234 | if (fgnax3) | 
|---|
| 235 | sprintf(buff, "NAXIS2  = %20ld / Number of fibers ", (long)nax2); | 
|---|
| 236 | else | 
|---|
| 237 | sprintf(buff, "NAXIS2  = %20ld / NumberOfPaquets", (long)nax2); | 
|---|
| 238 | buff[strlen(buff)] = ' '; | 
|---|
| 239 | buff = header+400; | 
|---|
| 240 | if (fgnax3) | 
|---|
| 241 | sprintf(buff, "NAXIS3  = %20ld / Number of paquets ", (long)nax3); | 
|---|
| 242 | else | 
|---|
| 243 | strcpy(buff,"COMMENT  BAO-Radio / MiniFITSFile "); | 
|---|
| 244 | buff[strlen(buff)] = ' '; | 
|---|
| 245 |  | 
|---|
| 246 | buff = header+480+nkeya_*80; | 
|---|
| 247 | strcpy(buff,"COMMENT  BAO-Radio / MiniFITSFile "); | 
|---|
| 248 | buff[strlen(buff)] = ' '; | 
|---|
| 249 | buff = header+560+nkeya_*80; | 
|---|
| 250 | strcpy(buff,"END"); | 
|---|
| 251 | buff[strlen(buff)] = ' '; | 
|---|
| 252 |  | 
|---|
| 253 | return; | 
|---|
| 254 | } | 
|---|
| 255 |  | 
|---|
| 256 | /* --Methode-- */ | 
|---|
| 257 | int MiniFITSFile::AddKeyI(const char* key, long val, const char* comm) | 
|---|
| 258 | { | 
|---|
| 259 | if (nkeya_ >= 28) return 0; | 
|---|
| 260 | char cle[10]; | 
|---|
| 261 | strncpy(cle,key,8); | 
|---|
| 262 | cle[8]='='; | 
|---|
| 263 | for(int i=0;i<8;i++) | 
|---|
| 264 | if (cle[i]=='\0') cle[i]=' '; | 
|---|
| 265 | cle[9]='\0'; | 
|---|
| 266 | char* buff=header+480+nkeya_*80; | 
|---|
| 267 | if (comm!=NULL) { | 
|---|
| 268 | char tcom[50]; | 
|---|
| 269 | strncpy(tcom,comm,48); | 
|---|
| 270 | tcom[48]='\0'; | 
|---|
| 271 | sprintf(buff,"%s %20ld / %s", cle, val, tcom); | 
|---|
| 272 | } | 
|---|
| 273 | else  sprintf(buff,"%s %20ld / ", cle, val); | 
|---|
| 274 | buff[strlen(buff)]=' '; | 
|---|
| 275 | nkeya_++; | 
|---|
| 276 | return nkeya_; | 
|---|
| 277 | } | 
|---|
| 278 |  | 
|---|
| 279 | /* --Methode-- */ | 
|---|
| 280 | int MiniFITSFile::AddKeyD(const char* key, double val, const char* comm) | 
|---|
| 281 | { | 
|---|
| 282 | if (nkeya_ >= 28) return 0; | 
|---|
| 283 | char cle[10]; | 
|---|
| 284 | strncpy(cle,key,8); | 
|---|
| 285 | cle[8]='='; | 
|---|
| 286 | for(int i=0;i<8;i++) | 
|---|
| 287 | if (cle[i]=='\0') cle[i]=' '; | 
|---|
| 288 | cle[9]='\0'; | 
|---|
| 289 | char* buff=header+480+nkeya_*80; | 
|---|
| 290 | if (comm!=NULL) { | 
|---|
| 291 | char tcom[50]; | 
|---|
| 292 | strncpy(tcom,comm,48); | 
|---|
| 293 | tcom[48]='\0'; | 
|---|
| 294 | sprintf(buff,"%s %20lg / %s", cle, val, tcom); | 
|---|
| 295 | } | 
|---|
| 296 | else  sprintf(buff,"%s %20lg / ", cle, val); | 
|---|
| 297 | buff[strlen(buff)] = ' '; | 
|---|
| 298 | nkeya_++; | 
|---|
| 299 | return nkeya_; | 
|---|
| 300 | } | 
|---|
| 301 |  | 
|---|
| 302 | /* --Methode-- */ | 
|---|
| 303 | int MiniFITSFile::AddKeyS(const char* key, const char* val, const char* comm) | 
|---|
| 304 | { | 
|---|
| 305 | if (nkeya_ >= 28) return 0; | 
|---|
| 306 | char cle[10]; | 
|---|
| 307 | strncpy(cle,key,8); | 
|---|
| 308 | cle[8]='='; | 
|---|
| 309 | for(int i=0;i<8;i++) | 
|---|
| 310 | if (cle[i]=='\0') cle[i]=' '; | 
|---|
| 311 | cle[9]='\0'; | 
|---|
| 312 | char tcom[72]; | 
|---|
| 313 | tcom[0]='\''; | 
|---|
| 314 | strncpy(tcom+1,val,65); | 
|---|
| 315 | int l=strlen(tcom); | 
|---|
| 316 | strcpy(tcom+l,"' / "); | 
|---|
| 317 | l+=4; | 
|---|
| 318 | if ((l<70)&&(comm!=NULL)) strncpy(tcom+l,comm,70-l); | 
|---|
| 319 | tcom[70]='\0'; | 
|---|
| 320 | char* buff=header+480+nkeya_*80; | 
|---|
| 321 | sprintf(buff,"%s %s", cle, tcom); | 
|---|
| 322 | buff[strlen(buff)] = ' '; | 
|---|
| 323 | nkeya_++; | 
|---|
| 324 | return nkeya_; | 
|---|
| 325 | } | 
|---|
| 326 |  | 
|---|
| 327 | /* --Methode-- */ | 
|---|
| 328 | string MiniFITSFile::GetKey(const char* key) | 
|---|
| 329 | { | 
|---|
| 330 | char rs[80]; | 
|---|
| 331 | rs[0]='\0'; | 
|---|
| 332 | char cle[10]; | 
|---|
| 333 | strncpy(cle,key,8); | 
|---|
| 334 | cle[8]='='; | 
|---|
| 335 | for(int i=0;i<8;i++) | 
|---|
| 336 | if (cle[i]=='\0') cle[i]=' '; | 
|---|
| 337 | cle[9]='\0'; | 
|---|
| 338 | for(int kh=80; kh<2800; kh+=80) { | 
|---|
| 339 | char * buff = header+kh; | 
|---|
| 340 | if (strncmp(buff, cle, 9) == 0)  { | 
|---|
| 341 | strncpy(rs, buff, 79); | 
|---|
| 342 | rs[79]='\0'; | 
|---|
| 343 | break; | 
|---|
| 344 | } | 
|---|
| 345 | } | 
|---|
| 346 | return rs; | 
|---|
| 347 | } | 
|---|
| 348 |  | 
|---|
| 349 | /* --Methode-- */ | 
|---|
| 350 | string MiniFITSFile::GetKeyValue(const char* key) | 
|---|
| 351 | { | 
|---|
| 352 | string line = GetKey(key); | 
|---|
| 353 | if(line.size()==0) return ""; | 
|---|
| 354 | char rs[84], sep = '?'; | 
|---|
| 355 | bool foundeq = false; | 
|---|
| 356 | unsigned int ip = 0; | 
|---|
| 357 | for(unsigned int i=0;i<line.size();i++) { | 
|---|
| 358 | if(!foundeq) {if(line[i] == '=') foundeq = true; continue;} | 
|---|
| 359 | if(sep=='?') {  // recherche du separateur de debut | 
|---|
| 360 | if(line[i]==' ') continue; | 
|---|
| 361 | if(line[i]=='\'' || line[i]=='\"') {sep = line[i]; continue;} | 
|---|
| 362 | else sep = ' '; | 
|---|
| 363 | } | 
|---|
| 364 | if(line[i]==sep) break; | 
|---|
| 365 | rs[ip] = line[i]; | 
|---|
| 366 | ip++; | 
|---|
| 367 | } | 
|---|
| 368 | rs[ip] = '\0'; | 
|---|
| 369 | return rs; | 
|---|
| 370 | } | 
|---|
| 371 |  | 
|---|
| 372 | /* --Methode-- */ | 
|---|
| 373 | void MiniFITSFile::DecodeHeader() | 
|---|
| 374 | { | 
|---|
| 375 | // AMELIORER le decodage de l'entete, remplissage dtype, nax1, nax2 | 
|---|
| 376 | char * buff = header; | 
|---|
| 377 | if (strncmp(buff, "SIMPLE  =", 9) != 0) | 
|---|
| 378 | throw MiniFITSException("MiniFITSFile::DecodeHeader()/Error - NO SIMPLE keyword"); | 
|---|
| 379 | bool fgokt=false; | 
|---|
| 380 | bool fgok1=false; | 
|---|
| 381 | bool fgok2=false; | 
|---|
| 382 | bool fgok3=false; | 
|---|
| 383 | for(int kh=80; kh<2800; kh+=80) { | 
|---|
| 384 | buff = header+kh; | 
|---|
| 385 | if (strncmp(buff, "NAXIS1  =", 9) == 0)  { | 
|---|
| 386 | nax1 = atol(buff+10); | 
|---|
| 387 | fgok1 = true; | 
|---|
| 388 | //          cout << " FOUND : NAXIS1= " << nax1 << endl; | 
|---|
| 389 | } | 
|---|
| 390 | else if (strncmp(buff, "NAXIS2  =", 9) == 0)  { | 
|---|
| 391 | nax2 = atol(buff+10); | 
|---|
| 392 | fgok2 = true; | 
|---|
| 393 | //          cout << " FOUND : NAXIS2= " << nax2 << endl; | 
|---|
| 394 | } | 
|---|
| 395 | else if (strncmp(buff, "NAXIS3  =", 9) == 0)  { | 
|---|
| 396 | nax3 = atol(buff+10); | 
|---|
| 397 | fgok3 = true; | 
|---|
| 398 | //          cout << " FOUND : NAXIS2= " << nax2 << endl; | 
|---|
| 399 | } | 
|---|
| 400 | else if (strncmp(buff, "BITPIX  =", 9) == 0)  { | 
|---|
| 401 | int bpix = atoi(buff+10); | 
|---|
| 402 | fgokt = true; | 
|---|
| 403 | if (bpix == 8)  dtype = MF_Byte; | 
|---|
| 404 | else if (bpix == 16)  dtype = MF_Int16; | 
|---|
| 405 | else if (bpix == -32)  dtype = MF_Float32; | 
|---|
| 406 | else fgokt = false; | 
|---|
| 407 | //          cout << " FOUND : bpix= " << bpix << endl; | 
|---|
| 408 | } | 
|---|
| 409 | } | 
|---|
| 410 | if (!(fgok1&&fgok2&&fgokt)) | 
|---|
| 411 | throw MiniFITSException("MiniFITSFile::DecodeHeader()/Error- Missing/wrong NAXIS1/2,BITPIX"); | 
|---|
| 412 | if (fgok3)  fgnax3=true; | 
|---|
| 413 | return; | 
|---|
| 414 | } | 
|---|
| 415 |  | 
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