1 | #include "sopnamsp.h"
|
---|
2 | #include "pexceptions.h"
|
---|
3 | #include "fitsautoreader.h"
|
---|
4 | #include "dvlist.h"
|
---|
5 |
|
---|
6 | ///////////////////////////////////////////////////////////////////////
|
---|
7 | // ---- gestion de persistance I/O format fits--
|
---|
8 | // objets
|
---|
9 | ////////////////////////////////////////////////////////////////////
|
---|
10 |
|
---|
11 | /*!
|
---|
12 | \class SOPHYA::FITS_AutoReader
|
---|
13 | \ingroup FitsIOServer
|
---|
14 | FITS reader with automatic mapping on SOPHYA objects.
|
---|
15 | */
|
---|
16 |
|
---|
17 | FITS_AutoReader::FITS_AutoReader() {InitNull();};
|
---|
18 | FITS_AutoReader::FITS_AutoReader(const char inputfile[])
|
---|
19 | {
|
---|
20 | InitNull();
|
---|
21 | inFits_ = new FitsInFile (inputfile);
|
---|
22 | filename_ = string(inputfile);
|
---|
23 | }
|
---|
24 | FITS_AutoReader::FITS_AutoReader(string const & inputfile)
|
---|
25 | {
|
---|
26 | InitNull();
|
---|
27 | inFits_ = new FitsInFile (inputfile);
|
---|
28 | filename_ = inputfile;
|
---|
29 | }
|
---|
30 | FITS_AutoReader::~FITS_AutoReader()
|
---|
31 | {
|
---|
32 | if (inFits_ != NULL) delete inFits_;
|
---|
33 | if (dobj_ != NULL) delete dobj_;
|
---|
34 | }
|
---|
35 |
|
---|
36 | int FITS_AutoReader::NbBlocks()
|
---|
37 | {
|
---|
38 | return inFits_->NbBlocks();
|
---|
39 | }
|
---|
40 |
|
---|
41 | // parametre toutCharger : uniquement pour les BINTABLE et s'il ne
|
---|
42 | // s'agit pas explicitement d'un objet SOPHYA, on charge toute la
|
---|
43 | // table en memoire sous forme d'un xntuple si toutCharger= true.
|
---|
44 | // et si le nombre d'entrees est superieur a 1000.
|
---|
45 | // sinon (c-a-d : il ne s'agit pas d'un objet connu de SOPHYA
|
---|
46 | // c'est une BINTABLE avec plus de 1000 entrees
|
---|
47 | // totuCharger = false)
|
---|
48 | // on ouvre une FitsBTNtuIntf (lecture ulterieure, bufferisee, des valeurs)
|
---|
49 | AnyDataObj* FITS_AutoReader::ReadObject(int hdunum, bool toutCharger) const
|
---|
50 | {
|
---|
51 | if (hdunum<=0)
|
---|
52 | {
|
---|
53 | throw PException(" FITS_AutoReader::ReadObject : hdu number must be positive");
|
---|
54 | }
|
---|
55 | inFits_->ReadHeader(hdunum);
|
---|
56 | if (inFits_->IsFitsEOF()) return NULL;
|
---|
57 | if (inFits_->IsFitsERROR())
|
---|
58 | {
|
---|
59 | throw IOExc("FITS_AutoReader::ReadObject: FITSIO error in reading");
|
---|
60 | }
|
---|
61 | DVList dvl=inFits_->DVListFromFits();
|
---|
62 | string nameObj = dvl.GetS("CONTENT");
|
---|
63 | // cout << " SOPHYA object identified as: " << dvl.GetS("CONTENT") << endl;
|
---|
64 | if (nameObj == string("TArray") )
|
---|
65 | {
|
---|
66 | return newTArray();
|
---|
67 | }
|
---|
68 | else if (nameObj == string("SphereHEALPix") )
|
---|
69 | {
|
---|
70 | return newSphereHEALPix();
|
---|
71 | }
|
---|
72 | else if (nameObj == string("LocalMap") )
|
---|
73 | {
|
---|
74 | return newLocalMap();
|
---|
75 | }
|
---|
76 | else if (nameObj == string("NTuple") )
|
---|
77 | {
|
---|
78 | return newNTuple();
|
---|
79 | }
|
---|
80 | else if (nameObj == string("XNTuple") )
|
---|
81 | {
|
---|
82 | return newXNTuple();
|
---|
83 | }
|
---|
84 | // on n'a trouve aucun nom d'objet connu de SOPHYA, on fait une
|
---|
85 | // recherche qualitative.
|
---|
86 | //
|
---|
87 | // si c'est une image fits, on cree un TArray
|
---|
88 | else if (inFits_->IsFitsImage())
|
---|
89 | {
|
---|
90 | return newTArray();
|
---|
91 | }
|
---|
92 | // si c'est une bintable on cherche le mot cle ORDERING pour identifier
|
---|
93 | // une spherehealpix
|
---|
94 | else if (inFits_->IsFitsTable())
|
---|
95 | {
|
---|
96 | if (dvl.GetS("ORDERING") != string("")) return newSphereHEALPix();
|
---|
97 | // sinon on cherche ntuple ou xntuple
|
---|
98 | else
|
---|
99 | {
|
---|
100 | int index=0;
|
---|
101 | int k;
|
---|
102 | for (k=0; k < inFits_->NbColsFromFits(); k++)
|
---|
103 | {
|
---|
104 | if (inFits_->ColTypeFromFits(k) != FitsFile::FitsDataType_float)
|
---|
105 | {
|
---|
106 | index = 1;
|
---|
107 | break;
|
---|
108 | }
|
---|
109 | }
|
---|
110 | if (index == 0) return newNTuple();
|
---|
111 | else
|
---|
112 | {
|
---|
113 | if (!toutCharger )
|
---|
114 | {
|
---|
115 | int maxEntries=0;
|
---|
116 | int k;
|
---|
117 | for ( k=0; k < inFits_->NbColsFromFits(); k++)
|
---|
118 | {
|
---|
119 | if (inFits_->NentriesFromFits(k) > maxEntries ) maxEntries = inFits_->NentriesFromFits(k);
|
---|
120 | }
|
---|
121 | if ( maxEntries > 1000) return newFitsBTNtuIntf(hdunum);
|
---|
122 | else return newXNTuple();
|
---|
123 | }
|
---|
124 | else return newXNTuple();
|
---|
125 |
|
---|
126 | }
|
---|
127 | }
|
---|
128 | }
|
---|
129 | else
|
---|
130 | {
|
---|
131 | cout << " WARNING ( FITS_AutoReader::ReadObject) : object not recognized as a SOPHYA object" << endl;
|
---|
132 | return new DVList(dvl);
|
---|
133 | }
|
---|
134 |
|
---|
135 | }
|
---|
136 |
|
---|
137 | AnyDataObj* FITS_AutoReader::newTArray() const
|
---|
138 | {
|
---|
139 | FitsFile::FitsDataType dtype = inFits_->ImageType();
|
---|
140 | switch (dtype)
|
---|
141 | {
|
---|
142 | case FitsFile::FitsDataType_double :
|
---|
143 | {
|
---|
144 | TArray<r_8>* matptr = new TArray<r_8>;
|
---|
145 | FITS_TArray<r_8> fta(matptr);
|
---|
146 | fta.Read(*inFits_, inFits_->currentHeaderIndex());
|
---|
147 | return matptr;
|
---|
148 | }
|
---|
149 | case FitsFile::FitsDataType_float :
|
---|
150 | {
|
---|
151 | TArray<r_4>* matptr = new TArray<r_4>;
|
---|
152 | FITS_TArray<r_4> fta(matptr);
|
---|
153 | fta.Read(*inFits_, inFits_->currentHeaderIndex());
|
---|
154 | return matptr;
|
---|
155 | }
|
---|
156 | case FitsFile::FitsDataType_int :
|
---|
157 | {
|
---|
158 | TArray<int_4>* matptr = new TArray<int_4>;
|
---|
159 | FITS_TArray<int_4> fta(matptr);
|
---|
160 | fta.Read(*inFits_, inFits_->currentHeaderIndex());
|
---|
161 | return matptr;
|
---|
162 | }
|
---|
163 | default :
|
---|
164 | cout << "type = " << (int) dtype << endl;
|
---|
165 | throw IOExc("FITS_AutoReader::ReadObject : unsupported data type for TArray");
|
---|
166 | }
|
---|
167 | }
|
---|
168 |
|
---|
169 | AnyDataObj* FITS_AutoReader::newSphereHEALPix() const
|
---|
170 | {
|
---|
171 | FitsFile::FitsDataType dtype;
|
---|
172 | if (inFits_->IsFitsTable()) dtype = inFits_->ColTypeFromFits(0);
|
---|
173 | else
|
---|
174 | {
|
---|
175 | cout << " WARNING : Sperehealpix not binary table : unusual " << endl;
|
---|
176 | dtype = inFits_->ImageType();
|
---|
177 | }
|
---|
178 | switch (dtype)
|
---|
179 | {
|
---|
180 | case FitsFile::FitsDataType_double :
|
---|
181 | {
|
---|
182 | SphereHEALPix<r_8>* sphptr = new SphereHEALPix<r_8>;
|
---|
183 | FITS_SphereHEALPix<r_8> fta(sphptr);
|
---|
184 | fta.Read(*inFits_, inFits_->currentHeaderIndex());
|
---|
185 | return sphptr;
|
---|
186 | }
|
---|
187 | case FitsFile::FitsDataType_float :
|
---|
188 | {
|
---|
189 | SphereHEALPix<r_4>* sphptr = new SphereHEALPix<r_4>;
|
---|
190 | FITS_SphereHEALPix<r_4> fta(sphptr);
|
---|
191 | fta.Read(*inFits_, inFits_->currentHeaderIndex());
|
---|
192 | return sphptr;
|
---|
193 | }
|
---|
194 | //CMV: Bon c'est quand meme sympa de pouvoir re-lire ce
|
---|
195 | // qu'on a ecrit !! Je fais cette modif mais a priori
|
---|
196 | // ce n'est que du sparadra car ca devrait planter
|
---|
197 | // sur certaines machines (int!=long).
|
---|
198 | case FitsFile::FitsDataType_int :
|
---|
199 | case FitsFile::FitsDataType_long :
|
---|
200 | {
|
---|
201 | SphereHEALPix<int_4>* sphptr = new SphereHEALPix<int_4>;
|
---|
202 | FITS_SphereHEALPix<int_4> fta(sphptr);
|
---|
203 | fta.Read(*inFits_, inFits_->currentHeaderIndex());
|
---|
204 | return sphptr;
|
---|
205 | }
|
---|
206 | default :
|
---|
207 | cout << "type = " << (int) dtype << endl;
|
---|
208 | throw IOExc("FITS_AutoReader::ReadObject : unsupported data type for SphereHEALpix");
|
---|
209 | }
|
---|
210 | }
|
---|
211 |
|
---|
212 | AnyDataObj* FITS_AutoReader::newLocalMap() const
|
---|
213 | {
|
---|
214 | FitsFile::FitsDataType dtype;
|
---|
215 | if (inFits_->IsFitsTable()) dtype = inFits_->ColTypeFromFits(0);
|
---|
216 | else
|
---|
217 | {
|
---|
218 | cout << " WARNING : Localmap not binary table : unusual " << endl;
|
---|
219 | dtype = inFits_->ImageType();
|
---|
220 | }
|
---|
221 | switch (dtype)
|
---|
222 | {
|
---|
223 | case FitsFile::FitsDataType_double :
|
---|
224 | {
|
---|
225 | LocalMap<r_8>* locmptr = new LocalMap<r_8>;
|
---|
226 | FITS_LocalMap<r_8> fta(locmptr);
|
---|
227 | fta.Read(*inFits_, inFits_->currentHeaderIndex());
|
---|
228 | return locmptr;
|
---|
229 | }
|
---|
230 | case FitsFile::FitsDataType_float :
|
---|
231 | {
|
---|
232 | LocalMap<r_4>* locmptr = new LocalMap<r_4>;
|
---|
233 | FITS_LocalMap<r_4> fta(locmptr);
|
---|
234 | fta.Read(*inFits_, inFits_->currentHeaderIndex());
|
---|
235 | return locmptr;
|
---|
236 | }
|
---|
237 | case FitsFile::FitsDataType_int :
|
---|
238 | {
|
---|
239 | LocalMap<int_4>* locmptr = new LocalMap<int_4>;
|
---|
240 | FITS_LocalMap<int_4> fta(locmptr);
|
---|
241 | fta.Read(*inFits_, inFits_->currentHeaderIndex());
|
---|
242 | return locmptr;
|
---|
243 | }
|
---|
244 | default :
|
---|
245 | cout << "type = " << (int) dtype << endl;
|
---|
246 | throw IOExc("FITS_AutoReader::ReadObject : unsupported data type for LocalMap");
|
---|
247 | }
|
---|
248 | }
|
---|
249 | NTuple* FITS_AutoReader::newNTuple() const
|
---|
250 | {
|
---|
251 | NTuple* ntptr = new NTuple;
|
---|
252 | FITS_NTuple fta(ntptr);
|
---|
253 | fta.Read(*inFits_, inFits_->currentHeaderIndex());
|
---|
254 | return ntptr;
|
---|
255 | }
|
---|
256 | XNTuple* FITS_AutoReader::newXNTuple() const
|
---|
257 | {
|
---|
258 | XNTuple* xntptr = new XNTuple;
|
---|
259 | FITS_XNTuple fta(xntptr);
|
---|
260 | fta.Read(*inFits_, inFits_->currentHeaderIndex());
|
---|
261 | return xntptr;
|
---|
262 | }
|
---|
263 |
|
---|
264 | FitsBTNtuIntf* FITS_AutoReader::newFitsBTNtuIntf(int hdunum) const
|
---|
265 | {
|
---|
266 | FitsBTNtuIntf* btnptr = new FitsBTNtuIntf(filename_,hdunum);
|
---|
267 | return btnptr;
|
---|
268 | }
|
---|
269 |
|
---|