| [2615] | 1 | #include "sopnamsp.h"
 | 
|---|
| [860] | 2 | #include "pexceptions.h"
 | 
|---|
 | 3 | #include "fitsntuple.h"
 | 
|---|
 | 4 | ///////////////////////////////////////////////////////////
 | 
|---|
 | 5 | //   Les objets delegues pour la gestion de persistance sur fichiers fits 
 | 
|---|
 | 6 | //    pout NTuple
 | 
|---|
 | 7 | ///////////////////////////////////////////////////////////
 | 
|---|
 | 8 | 
 | 
|---|
 | 9 | 
 | 
|---|
 | 10 | #define LONNOM 8
 | 
|---|
 | 11 | #define LONNOM1  (LONNOM+1)
 | 
|---|
 | 12 | 
 | 
|---|
 | 13 | 
 | 
|---|
| [1371] | 14 | /*!
 | 
|---|
 | 15 |   \class SOPHYA::FITS_NTuple
 | 
|---|
 | 16 |   \ingroup FitsIOServer
 | 
|---|
 | 17 |   FITS format I/O handler for SOPHYA::NTuple objects.
 | 
|---|
 | 18 | */
 | 
|---|
| [860] | 19 | 
 | 
|---|
 | 20 | FITS_NTuple::FITS_NTuple()
 | 
|---|
 | 21 | {
 | 
|---|
 | 22 |   dobj_ = new NTuple;
 | 
|---|
| [1047] | 23 |   InitNull();
 | 
|---|
 | 24 |   ownobj_ = true;
 | 
|---|
| [860] | 25 | }
 | 
|---|
 | 26 | 
 | 
|---|
 | 27 | FITS_NTuple::FITS_NTuple(char inputfile[],int hdunum)
 | 
|---|
 | 28 | {
 | 
|---|
 | 29 |   dobj_ = new NTuple;
 | 
|---|
| [1047] | 30 |   InitNull();
 | 
|---|
 | 31 |   ownobj_ = true; 
 | 
|---|
| [860] | 32 | 
 | 
|---|
| [1136] | 33 |   Read(inputfile,hdunum);
 | 
|---|
| [860] | 34 | }
 | 
|---|
 | 35 | 
 | 
|---|
 | 36 | 
 | 
|---|
 | 37 | FITS_NTuple::FITS_NTuple(const NTuple & obj) 
 | 
|---|
 | 38 | { 
 | 
|---|
 | 39 |   dobj_ = new NTuple(obj);
 | 
|---|
| [1047] | 40 |   InitNull();
 | 
|---|
 | 41 |   ownobj_ = true; 
 | 
|---|
| [860] | 42 | }
 | 
|---|
| [1047] | 43 | FITS_NTuple::FITS_NTuple(NTuple* obj) 
 | 
|---|
 | 44 | { 
 | 
|---|
 | 45 |   dobj_ = obj;
 | 
|---|
 | 46 |   InitNull();
 | 
|---|
 | 47 |   ownobj_ = false; 
 | 
|---|
 | 48 | }
 | 
|---|
| [860] | 49 | 
 | 
|---|
 | 50 | 
 | 
|---|
 | 51 | FITS_NTuple::~FITS_NTuple()
 | 
|---|
 | 52 | {
 | 
|---|
| [1047] | 53 |   if (ownobj_ && dobj_ != NULL) delete dobj_;
 | 
|---|
| [1136] | 54 |   //  if (column_ != NULL) delete [] column_;
 | 
|---|
| [860] | 55 | }
 | 
|---|
 | 56 | 
 | 
|---|
| [2897] | 57 | int  FITS_NTuple::CheckReadability(FitsInOutFile& is)
 | 
|---|
 | 58 | {
 | 
|---|
 | 59 |   if (is.CurrentHDUType() == IMAGE_HDU ) return 0;
 | 
|---|
 | 60 |   string key = "SOPCLSNM"; 
 | 
|---|
 | 61 |   string clsnm = is.KeyValue(key);
 | 
|---|
 | 62 |   if (clsnm == "SOPHYA::NTuple")  return 2;
 | 
|---|
| [2898] | 63 |   key = "Content";
 | 
|---|
 | 64 |   if (is.KeyValue(key) == "NTuple") return 2;
 | 
|---|
| [2897] | 65 |   else return 1;
 | 
|---|
 | 66 | }
 | 
|---|
 | 67 | 
 | 
|---|
| [1136] | 68 | //void FITS_NTuple::Read(char inputfile[],int hdunum)
 | 
|---|
 | 69 | //{
 | 
|---|
 | 70 | //  ReadF(inputfile,hdunum);
 | 
|---|
 | 71 | //}
 | 
|---|
| [1047] | 72 | void FITS_NTuple::ReadLines(char inputfile[],int firstLine, int numberOfLines,int hdunum)
 | 
|---|
 | 73 | {
 | 
|---|
 | 74 |   fistLineToBeRead_ = firstLine;
 | 
|---|
 | 75 |   numberOfLinesToBeRead_ = numberOfLines;
 | 
|---|
| [1136] | 76 |   Read(inputfile,hdunum);
 | 
|---|
| [1047] | 77 | }
 | 
|---|
 | 78 | 
 | 
|---|
 | 79 | 
 | 
|---|
 | 80 | 
 | 
|---|
| [1136] | 81 | //void FITS_NTuple::Write(char outputfile[], bool OldFile)
 | 
|---|
 | 82 | //{
 | 
|---|
 | 83 | //  WriteF(outputfile, OldFile);
 | 
|---|
 | 84 | //}
 | 
|---|
| [860] | 85 | 
 | 
|---|
| [1136] | 86 | void FITS_NTuple::ReadFromFits(FitsInFile& is)
 | 
|---|
| [860] | 87 | {
 | 
|---|
| [1136] | 88 |   if (!is.IsFitsTable())
 | 
|---|
| [860] | 89 |     {
 | 
|---|
 | 90 |       throw PException("ReadFromFits: the fits file seems not to be a bintable nor ASCII table");
 | 
|---|
 | 91 |     }
 | 
|---|
 | 92 |   int nbcols, nbentries;
 | 
|---|
| [1136] | 93 |   nbcols = is.NbColsFromFits();
 | 
|---|
| [860] | 94 |   nbentries = 0;
 | 
|---|
| [923] | 95 |   int k;
 | 
|---|
| [1136] | 96 |   for (k=0; k<nbcols; k++) nbentries=max( nbentries, is.NentriesFromFits(k) );
 | 
|---|
| [860] | 97 |   
 | 
|---|
 | 98 |   char ** ColName = new char*[nbcols];
 | 
|---|
 | 99 |   
 | 
|---|
| [923] | 100 |   for (k=0; k<nbcols;k++) 
 | 
|---|
| [860] | 101 |     {
 | 
|---|
 | 102 |       ColName[k] = new char[LONNOM1]; 
 | 
|---|
| [1136] | 103 |       strncpy(ColName[k], is.ColNameFromFits(k).c_str(),LONNOM);
 | 
|---|
| [860] | 104 |       ColName[k][LONNOM] =  '\0';
 | 
|---|
 | 105 |     }
 | 
|---|
| [2907] | 106 |   // Reza Dec 2006 : Colonnes du NTuple de type double par defaut 
 | 
|---|
| [923] | 107 |   for (k=0; k<nbcols;k++)
 | 
|---|
| [860] | 108 |     {
 | 
|---|
| [1300] | 109 |       FitsFile::FitsDataType ss= is.ColTypeFromFits(k);
 | 
|---|
| [860] | 110 |       string type;
 | 
|---|
| [2907] | 111 |       if ( (ss !=  FitsFile::FitsDataType_double) && (ss != FitsFile::FitsDataType_float) )
 | 
|---|
| [860] | 112 |         {
 | 
|---|
| [2907] | 113 |           if (ss == FitsFile::FitsDataType_int) type= string("integer");
 | 
|---|
| [860] | 114 |           else
 | 
|---|
| [2907] | 115 |             if (ss == FitsFile::FitsDataType_char) type = string("char*");
 | 
|---|
| [860] | 116 |             else
 | 
|---|
| [2907] | 117 |               type = string("unknown");
 | 
|---|
| [860] | 118 |           cout << " WARNING: the column " << k << " on fits file is not float but : " << type << endl;
 | 
|---|
 | 119 |         } 
 | 
|---|
 | 120 |     }
 | 
|---|
| [2907] | 121 |   bool fgdouble = true;
 | 
|---|
 | 122 |   if ( is.ColTypeFromFits(0) == FitsFile::FitsDataType_float ) fgdouble = false;
 | 
|---|
| [860] | 123 |   if(dobj_ == NULL) 
 | 
|---|
 | 124 |     { 
 | 
|---|
| [2907] | 125 |       dobj_= new NTuple(nbcols,ColName,512,fgdouble);
 | 
|---|
| [1047] | 126 |       ownobj_ = true;      
 | 
|---|
| [860] | 127 |     }
 | 
|---|
 | 128 |   else 
 | 
|---|
 | 129 |     {
 | 
|---|
 | 130 |       dobj_->Clean();
 | 
|---|
| [2907] | 131 |       (*dobj_) = NTuple(nbcols,ColName,512,fgdouble);
 | 
|---|
| [860] | 132 |     }
 | 
|---|
| [923] | 133 |   for (k=0; k<nbcols;k++) 
 | 
|---|
| [860] | 134 |     {
 | 
|---|
 | 135 |       delete [] ColName[k];
 | 
|---|
 | 136 |     }
 | 
|---|
 | 137 |   delete [] ColName;
 | 
|---|
 | 138 | 
 | 
|---|
| [2907] | 139 |   // Reza Dec 2006 : Colonnes du NTuple de type double par defaut 
 | 
|---|
 | 140 |   double* dligne = NULL;
 | 
|---|
 | 141 |   float* fligne = NULL;
 | 
|---|
 | 142 |   if (fgdouble) dligne = new double[nbcols];
 | 
|---|
 | 143 |   else fligne = new float[nbcols];
 | 
|---|
| [1047] | 144 | 
 | 
|---|
| [1136] | 145 |   int firstln, lastln;
 | 
|---|
 | 146 |   if (numberOfLinesToBeRead_ > 0) 
 | 
|---|
 | 147 |     {
 | 
|---|
 | 148 |       firstln = fistLineToBeRead_;
 | 
|---|
 | 149 |       lastln = firstln + numberOfLinesToBeRead_;
 | 
|---|
 | 150 |     }
 | 
|---|
 | 151 |   else
 | 
|---|
 | 152 |     {
 | 
|---|
 | 153 |       firstln = 0;
 | 
|---|
 | 154 |       lastln  = nbentries;
 | 
|---|
 | 155 |     }
 | 
|---|
 | 156 |   int numLigne;
 | 
|---|
| [2907] | 157 |   if (fgdouble) 
 | 
|---|
 | 158 |     for (numLigne=firstln; numLigne < lastln; numLigne++) {
 | 
|---|
 | 159 |       is.GetBinTabLine(numLigne, dligne);
 | 
|---|
 | 160 |       dobj_->Fill((r_8*)dligne);
 | 
|---|
| [1136] | 161 |     }
 | 
|---|
| [2907] | 162 |   else 
 | 
|---|
 | 163 |     for (numLigne=firstln; numLigne < lastln; numLigne++) {
 | 
|---|
 | 164 |       is.GetBinTabLine(numLigne, fligne);
 | 
|---|
 | 165 |       dobj_->Fill((r_4*)fligne);
 | 
|---|
 | 166 |     }
 | 
|---|
 | 167 |   
 | 
|---|
 | 168 |   if (dligne) delete [] dligne;
 | 
|---|
 | 169 |   if (fligne) delete [] fligne;
 | 
|---|
| [1047] | 170 | 
 | 
|---|
| [1136] | 171 |   dobj_->Info()=is.DVListFromFits();
 | 
|---|
 | 172 | }
 | 
|---|
| [1047] | 173 | 
 | 
|---|
| [1136] | 174 | void FITS_NTuple::WriteToFits(FitsOutFile& os) 
 | 
|---|
| [860] | 175 | {
 | 
|---|
 | 176 |   if(dobj_ == NULL) 
 | 
|---|
 | 177 |     {
 | 
|---|
 | 178 |       cout << " WriteToFits:: dobj_= null " << endl;
 | 
|---|
 | 179 |       return;
 | 
|---|
 | 180 |     }
 | 
|---|
 | 181 | 
 | 
|---|
 | 182 |   // table will have 'ncols'  columns
 | 
|---|
 | 183 |   int ncols = dobj_->NVar();
 | 
|---|
 | 184 | 
 | 
|---|
 | 185 |   // table will have 'nrows' rows
 | 
|---|
 | 186 |   int nentries = dobj_->NEntry();
 | 
|---|
 | 187 | 
 | 
|---|
 | 188 |   // get names and values from the join DVList object
 | 
|---|
 | 189 |   DVList dvl= dobj_->Info();
 | 
|---|
| [1300] | 190 |   dvl["Content"]= "NTuple";
 | 
|---|
 | 191 |   dvl.SetComment("Content", "name of SOPHYA object");
 | 
|---|
| [2897] | 192 |   dvl["SOPCLSNM"]= "SOPHYA::NTuple";
 | 
|---|
 | 193 |   dvl.SetComment("SOPCLSNM", "SOPHYA class name");
 | 
|---|
| [860] | 194 |   // extension name
 | 
|---|
| [2897] | 195 |   // string extname("NTuple_Binary_tbl"); 
 | 
|---|
 | 196 |   string extname = os.NextExtensionName();
 | 
|---|
| [860] | 197 | 
 | 
|---|
| [1194] | 198 |   vector<string> Noms(ncols);   
 | 
|---|
| [923] | 199 |   int k;
 | 
|---|
 | 200 |   for (k=0; k< ncols; k++)
 | 
|---|
| [860] | 201 |     {
 | 
|---|
| [1194] | 202 |       Noms[k]= dobj_->NomIndex(k);
 | 
|---|
| [860] | 203 |     }
 | 
|---|
| [1136] | 204 | 
 | 
|---|
| [2907] | 205 |   // Gestion NTuple en double ou float / Reza Jan 2006
 | 
|---|
 | 206 |   if (dobj_->mFgDouble) {    // NTuple avec colonnes double
 | 
|---|
 | 207 |     string type(ncols, 'D');
 | 
|---|
 | 208 |     vector<int> dummy;
 | 
|---|
| [3067] | 209 |     // Reza 09/2006 : nentries -> 1  pour eviter les colonnes de type vecteur 
 | 
|---|
 | 210 |     os.makeHeaderBntblOnFits(type,Noms, 1, ncols, &dvl, extname, dummy);
 | 
|---|
| [2907] | 211 |     double* column =  new double[nentries];
 | 
|---|
 | 212 |     for (k=0; k<ncols;k++)
 | 
|---|
 | 213 |       {
 | 
|---|
 | 214 |         int j;
 | 
|---|
 | 215 |         for(j = 0; j < nentries; j++) column[j]= dobj_->GetCell(j,k);
 | 
|---|
 | 216 |         os.PutColToFits(k, nentries, column);
 | 
|---|
 | 217 |       }
 | 
|---|
 | 218 |     delete [] column;
 | 
|---|
 | 219 |   }
 | 
|---|
 | 220 |   else {   // NTuple avec colonnes float
 | 
|---|
 | 221 |     string type(ncols, 'E');
 | 
|---|
 | 222 |     vector<int> dummy;
 | 
|---|
| [3067] | 223 |     // Reza 09/2006 : nentries -> 1  pour eviter les colonnes de type vecteur 
 | 
|---|
 | 224 |     os.makeHeaderBntblOnFits(type,Noms, 1, ncols, &dvl, extname, dummy);
 | 
|---|
| [2907] | 225 |     float* column =  new float[nentries];
 | 
|---|
 | 226 |     for (k=0; k<ncols;k++)
 | 
|---|
 | 227 |       {
 | 
|---|
 | 228 |         int j;
 | 
|---|
 | 229 |         for(j = 0; j < nentries; j++) column[j]= dobj_->GetVal(j,k);
 | 
|---|
 | 230 |         os.PutColToFits(k, nentries, column);
 | 
|---|
 | 231 |       }
 | 
|---|
 | 232 |     delete [] column;
 | 
|---|
 | 233 |   }
 | 
|---|
| [860] | 234 | }
 | 
|---|
 | 235 | 
 | 
|---|