| 1 | #include "sopnamsp.h" | 
|---|
| 2 | #include "pexceptions.h" | 
|---|
| 3 | #include "fitsntuple.h" | 
|---|
| 4 | /////////////////////////////////////////////////////////// | 
|---|
| 5 | //   Les objets delegues pour la gestion de persistance sur fichiers fits | 
|---|
| 6 | //    pout NTuple | 
|---|
| 7 | /////////////////////////////////////////////////////////// | 
|---|
| 8 |  | 
|---|
| 9 |  | 
|---|
| 10 | #define LONNOM 8 | 
|---|
| 11 | #define LONNOM1  (LONNOM+1) | 
|---|
| 12 |  | 
|---|
| 13 |  | 
|---|
| 14 | /*! | 
|---|
| 15 | \class SOPHYA::FITS_NTuple | 
|---|
| 16 | \ingroup FitsIOServer | 
|---|
| 17 | FITS format I/O handler for SOPHYA::NTuple objects. | 
|---|
| 18 | */ | 
|---|
| 19 |  | 
|---|
| 20 | FITS_NTuple::FITS_NTuple() | 
|---|
| 21 | { | 
|---|
| 22 | dobj_ = new NTuple; | 
|---|
| 23 | InitNull(); | 
|---|
| 24 | ownobj_ = true; | 
|---|
| 25 | } | 
|---|
| 26 |  | 
|---|
| 27 | FITS_NTuple::FITS_NTuple(char inputfile[],int hdunum) | 
|---|
| 28 | { | 
|---|
| 29 | dobj_ = new NTuple; | 
|---|
| 30 | InitNull(); | 
|---|
| 31 | ownobj_ = true; | 
|---|
| 32 |  | 
|---|
| 33 | Read(inputfile,hdunum); | 
|---|
| 34 | } | 
|---|
| 35 |  | 
|---|
| 36 |  | 
|---|
| 37 | FITS_NTuple::FITS_NTuple(const NTuple & obj) | 
|---|
| 38 | { | 
|---|
| 39 | dobj_ = new NTuple(obj); | 
|---|
| 40 | InitNull(); | 
|---|
| 41 | ownobj_ = true; | 
|---|
| 42 | } | 
|---|
| 43 | FITS_NTuple::FITS_NTuple(NTuple* obj) | 
|---|
| 44 | { | 
|---|
| 45 | dobj_ = obj; | 
|---|
| 46 | InitNull(); | 
|---|
| 47 | ownobj_ = false; | 
|---|
| 48 | } | 
|---|
| 49 |  | 
|---|
| 50 |  | 
|---|
| 51 | FITS_NTuple::~FITS_NTuple() | 
|---|
| 52 | { | 
|---|
| 53 | if (ownobj_ && dobj_ != NULL) delete dobj_; | 
|---|
| 54 | //  if (column_ != NULL) delete [] column_; | 
|---|
| 55 | } | 
|---|
| 56 |  | 
|---|
| 57 | int  FITS_NTuple::CheckReadability(FitsInOutFile& is) | 
|---|
| 58 | { | 
|---|
| 59 | if (is.CurrentHDUType() == IMAGE_HDU ) return 0; | 
|---|
| 60 | string key = "SOPCLSNM"; | 
|---|
| 61 | string clsnm = is.KeyValue(key); | 
|---|
| 62 | if (clsnm == "SOPHYA::NTuple")  return 2; | 
|---|
| 63 | key = "Content"; | 
|---|
| 64 | if (is.KeyValue(key) == "NTuple") return 2; | 
|---|
| 65 | else return 1; | 
|---|
| 66 | } | 
|---|
| 67 |  | 
|---|
| 68 | //void FITS_NTuple::Read(char inputfile[],int hdunum) | 
|---|
| 69 | //{ | 
|---|
| 70 | //  ReadF(inputfile,hdunum); | 
|---|
| 71 | //} | 
|---|
| 72 | void FITS_NTuple::ReadLines(char inputfile[],int firstLine, int numberOfLines,int hdunum) | 
|---|
| 73 | { | 
|---|
| 74 | fistLineToBeRead_ = firstLine; | 
|---|
| 75 | numberOfLinesToBeRead_ = numberOfLines; | 
|---|
| 76 | Read(inputfile,hdunum); | 
|---|
| 77 | } | 
|---|
| 78 |  | 
|---|
| 79 |  | 
|---|
| 80 |  | 
|---|
| 81 | //void FITS_NTuple::Write(char outputfile[], bool OldFile) | 
|---|
| 82 | //{ | 
|---|
| 83 | //  WriteF(outputfile, OldFile); | 
|---|
| 84 | //} | 
|---|
| 85 |  | 
|---|
| 86 | void FITS_NTuple::ReadFromFits(FitsInFile& is) | 
|---|
| 87 | { | 
|---|
| 88 | if (!is.IsFitsTable()) | 
|---|
| 89 | { | 
|---|
| 90 | throw PException("ReadFromFits: the fits file seems not to be a bintable nor ASCII table"); | 
|---|
| 91 | } | 
|---|
| 92 | int nbcols, nbentries; | 
|---|
| 93 | nbcols = is.NbColsFromFits(); | 
|---|
| 94 | nbentries = 0; | 
|---|
| 95 | int k; | 
|---|
| 96 | for (k=0; k<nbcols; k++) nbentries=max( nbentries, is.NentriesFromFits(k) ); | 
|---|
| 97 |  | 
|---|
| 98 | char ** ColName = new char*[nbcols]; | 
|---|
| 99 |  | 
|---|
| 100 | for (k=0; k<nbcols;k++) | 
|---|
| 101 | { | 
|---|
| 102 | ColName[k] = new char[LONNOM1]; | 
|---|
| 103 | strncpy(ColName[k], is.ColNameFromFits(k).c_str(),LONNOM); | 
|---|
| 104 | ColName[k][LONNOM] =  '\0'; | 
|---|
| 105 | } | 
|---|
| 106 | // Reza Dec 2006 : Colonnes du NTuple de type double par defaut | 
|---|
| 107 | for (k=0; k<nbcols;k++) | 
|---|
| 108 | { | 
|---|
| 109 | FitsFile::FitsDataType ss= is.ColTypeFromFits(k); | 
|---|
| 110 | string type; | 
|---|
| 111 | if ( (ss !=  FitsFile::FitsDataType_double) && (ss != FitsFile::FitsDataType_float) ) | 
|---|
| 112 | { | 
|---|
| 113 | if (ss == FitsFile::FitsDataType_int) type= string("integer"); | 
|---|
| 114 | else | 
|---|
| 115 | if (ss == FitsFile::FitsDataType_char) type = string("char*"); | 
|---|
| 116 | else | 
|---|
| 117 | type = string("unknown"); | 
|---|
| 118 | cout << " WARNING: the column " << k << " on fits file is not float but : " << type << endl; | 
|---|
| 119 | } | 
|---|
| 120 | } | 
|---|
| 121 | bool fgdouble = true; | 
|---|
| 122 | if ( is.ColTypeFromFits(0) == FitsFile::FitsDataType_float ) fgdouble = false; | 
|---|
| 123 | if(dobj_ == NULL) | 
|---|
| 124 | { | 
|---|
| 125 | dobj_= new NTuple(nbcols,ColName,512,fgdouble); | 
|---|
| 126 | ownobj_ = true; | 
|---|
| 127 | } | 
|---|
| 128 | else | 
|---|
| 129 | { | 
|---|
| 130 | dobj_->Clean(); | 
|---|
| 131 | (*dobj_) = NTuple(nbcols,ColName,512,fgdouble); | 
|---|
| 132 | } | 
|---|
| 133 | for (k=0; k<nbcols;k++) | 
|---|
| 134 | { | 
|---|
| 135 | delete [] ColName[k]; | 
|---|
| 136 | } | 
|---|
| 137 | delete [] ColName; | 
|---|
| 138 |  | 
|---|
| 139 | // Reza Dec 2006 : Colonnes du NTuple de type double par defaut | 
|---|
| 140 | double* dligne = NULL; | 
|---|
| 141 | float* fligne = NULL; | 
|---|
| 142 | if (fgdouble) dligne = new double[nbcols]; | 
|---|
| 143 | else fligne = new float[nbcols]; | 
|---|
| 144 |  | 
|---|
| 145 | int firstln, lastln; | 
|---|
| 146 | if (numberOfLinesToBeRead_ > 0) | 
|---|
| 147 | { | 
|---|
| 148 | firstln = fistLineToBeRead_; | 
|---|
| 149 | lastln = firstln + numberOfLinesToBeRead_; | 
|---|
| 150 | } | 
|---|
| 151 | else | 
|---|
| 152 | { | 
|---|
| 153 | firstln = 0; | 
|---|
| 154 | lastln  = nbentries; | 
|---|
| 155 | } | 
|---|
| 156 | int numLigne; | 
|---|
| 157 | if (fgdouble) | 
|---|
| 158 | for (numLigne=firstln; numLigne < lastln; numLigne++) { | 
|---|
| 159 | is.GetBinTabLine(numLigne, dligne); | 
|---|
| 160 | dobj_->Fill((r_8*)dligne); | 
|---|
| 161 | } | 
|---|
| 162 | else | 
|---|
| 163 | for (numLigne=firstln; numLigne < lastln; numLigne++) { | 
|---|
| 164 | is.GetBinTabLine(numLigne, fligne); | 
|---|
| 165 | dobj_->Fill((r_4*)fligne); | 
|---|
| 166 | } | 
|---|
| 167 |  | 
|---|
| 168 | if (dligne) delete [] dligne; | 
|---|
| 169 | if (fligne) delete [] fligne; | 
|---|
| 170 |  | 
|---|
| 171 | dobj_->Info()=is.DVListFromFits(); | 
|---|
| 172 | } | 
|---|
| 173 |  | 
|---|
| 174 | void FITS_NTuple::WriteToFits(FitsOutFile& os) | 
|---|
| 175 | { | 
|---|
| 176 | if(dobj_ == NULL) | 
|---|
| 177 | { | 
|---|
| 178 | cout << " WriteToFits:: dobj_= null " << endl; | 
|---|
| 179 | return; | 
|---|
| 180 | } | 
|---|
| 181 |  | 
|---|
| 182 | // table will have 'ncols'  columns | 
|---|
| 183 | int ncols = dobj_->NVar(); | 
|---|
| 184 |  | 
|---|
| 185 | // table will have 'nrows' rows | 
|---|
| 186 | int nentries = dobj_->NEntry(); | 
|---|
| 187 |  | 
|---|
| 188 | // get names and values from the join DVList object | 
|---|
| 189 | DVList dvl= dobj_->Info(); | 
|---|
| 190 | dvl["Content"]= "NTuple"; | 
|---|
| 191 | dvl.SetComment("Content", "name of SOPHYA object"); | 
|---|
| 192 | dvl["SOPCLSNM"]= "SOPHYA::NTuple"; | 
|---|
| 193 | dvl.SetComment("SOPCLSNM", "SOPHYA class name"); | 
|---|
| 194 | // extension name | 
|---|
| 195 | // string extname("NTuple_Binary_tbl"); | 
|---|
| 196 | string extname = os.NextExtensionName(); | 
|---|
| 197 |  | 
|---|
| 198 | vector<string> Noms(ncols); | 
|---|
| 199 | int k; | 
|---|
| 200 | for (k=0; k< ncols; k++) | 
|---|
| 201 | { | 
|---|
| 202 | Noms[k]= dobj_->NomIndex(k); | 
|---|
| 203 | } | 
|---|
| 204 |  | 
|---|
| 205 | // Gestion NTuple en double ou float / Reza Jan 2006 | 
|---|
| 206 | if (dobj_->mFgDouble) {    // NTuple avec colonnes double | 
|---|
| 207 | string type(ncols, 'D'); | 
|---|
| 208 | vector<int> dummy; | 
|---|
| 209 | // Reza 09/2006 : nentries -> 1  pour eviter les colonnes de type vecteur | 
|---|
| 210 | os.makeHeaderBntblOnFits(type,Noms, 1, ncols, &dvl, extname, dummy); | 
|---|
| 211 | double* column =  new double[nentries]; | 
|---|
| 212 | for (k=0; k<ncols;k++) | 
|---|
| 213 | { | 
|---|
| 214 | int j; | 
|---|
| 215 | for(j = 0; j < nentries; j++) column[j]= dobj_->GetCell(j,k); | 
|---|
| 216 | os.PutColToFits(k, nentries, column); | 
|---|
| 217 | } | 
|---|
| 218 | delete [] column; | 
|---|
| 219 | } | 
|---|
| 220 | else {   // NTuple avec colonnes float | 
|---|
| 221 | string type(ncols, 'E'); | 
|---|
| 222 | vector<int> dummy; | 
|---|
| 223 | // Reza 09/2006 : nentries -> 1  pour eviter les colonnes de type vecteur | 
|---|
| 224 | os.makeHeaderBntblOnFits(type,Noms, 1, ncols, &dvl, extname, dummy); | 
|---|
| 225 | float* column =  new float[nentries]; | 
|---|
| 226 | for (k=0; k<ncols;k++) | 
|---|
| 227 | { | 
|---|
| 228 | int j; | 
|---|
| 229 | for(j = 0; j < nentries; j++) column[j]= dobj_->GetVal(j,k); | 
|---|
| 230 | os.PutColToFits(k, nentries, column); | 
|---|
| 231 | } | 
|---|
| 232 | delete [] column; | 
|---|
| 233 | } | 
|---|
| 234 | } | 
|---|
| 235 |  | 
|---|