| 1 | #include "sopnamsp.h"
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| 2 | #include "pexceptions.h"
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| 3 | #include "fitsntuple.h"
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| 4 | ///////////////////////////////////////////////////////////
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| 5 | // Les objets delegues pour la gestion de persistance sur fichiers fits
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| 6 | // pout NTuple
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| 7 | ///////////////////////////////////////////////////////////
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| 8 |
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| 9 |
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| 10 | #define LONNOM 8
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| 11 | #define LONNOM1 (LONNOM+1)
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| 12 |
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|---|
| 13 |
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|---|
| 14 | /*!
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|---|
| 15 | \class SOPHYA::FITS_NTuple
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|---|
| 16 | \ingroup FitsIOServer
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|---|
| 17 | FITS format I/O handler for SOPHYA::NTuple objects.
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|---|
| 18 | */
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|---|
| 19 |
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|---|
| 20 | FITS_NTuple::FITS_NTuple()
|
|---|
| 21 | {
|
|---|
| 22 | dobj_ = new NTuple;
|
|---|
| 23 | InitNull();
|
|---|
| 24 | ownobj_ = true;
|
|---|
| 25 | }
|
|---|
| 26 |
|
|---|
| 27 | FITS_NTuple::FITS_NTuple(char inputfile[],int hdunum)
|
|---|
| 28 | {
|
|---|
| 29 | dobj_ = new NTuple;
|
|---|
| 30 | InitNull();
|
|---|
| 31 | ownobj_ = true;
|
|---|
| 32 |
|
|---|
| 33 | Read(inputfile,hdunum);
|
|---|
| 34 | }
|
|---|
| 35 |
|
|---|
| 36 |
|
|---|
| 37 | FITS_NTuple::FITS_NTuple(const NTuple & obj)
|
|---|
| 38 | {
|
|---|
| 39 | dobj_ = new NTuple(obj);
|
|---|
| 40 | InitNull();
|
|---|
| 41 | ownobj_ = true;
|
|---|
| 42 | }
|
|---|
| 43 | FITS_NTuple::FITS_NTuple(NTuple* obj)
|
|---|
| 44 | {
|
|---|
| 45 | dobj_ = obj;
|
|---|
| 46 | InitNull();
|
|---|
| 47 | ownobj_ = false;
|
|---|
| 48 | }
|
|---|
| 49 |
|
|---|
| 50 |
|
|---|
| 51 | FITS_NTuple::~FITS_NTuple()
|
|---|
| 52 | {
|
|---|
| 53 | if (ownobj_ && dobj_ != NULL) delete dobj_;
|
|---|
| 54 | // if (column_ != NULL) delete [] column_;
|
|---|
| 55 | }
|
|---|
| 56 |
|
|---|
| 57 | int FITS_NTuple::CheckReadability(FitsInOutFile& is)
|
|---|
| 58 | {
|
|---|
| 59 | if (is.CurrentHDUType() == IMAGE_HDU ) return 0;
|
|---|
| 60 | string key = "SOPCLSNM";
|
|---|
| 61 | string clsnm = is.KeyValue(key);
|
|---|
| 62 | if (clsnm == "SOPHYA::NTuple") return 2;
|
|---|
| 63 | key = "Content";
|
|---|
| 64 | if (is.KeyValue(key) == "NTuple") return 2;
|
|---|
| 65 | else return 1;
|
|---|
| 66 | }
|
|---|
| 67 |
|
|---|
| 68 | //void FITS_NTuple::Read(char inputfile[],int hdunum)
|
|---|
| 69 | //{
|
|---|
| 70 | // ReadF(inputfile,hdunum);
|
|---|
| 71 | //}
|
|---|
| 72 | void FITS_NTuple::ReadLines(char inputfile[],int firstLine, int numberOfLines,int hdunum)
|
|---|
| 73 | {
|
|---|
| 74 | fistLineToBeRead_ = firstLine;
|
|---|
| 75 | numberOfLinesToBeRead_ = numberOfLines;
|
|---|
| 76 | Read(inputfile,hdunum);
|
|---|
| 77 | }
|
|---|
| 78 |
|
|---|
| 79 |
|
|---|
| 80 |
|
|---|
| 81 | //void FITS_NTuple::Write(char outputfile[], bool OldFile)
|
|---|
| 82 | //{
|
|---|
| 83 | // WriteF(outputfile, OldFile);
|
|---|
| 84 | //}
|
|---|
| 85 |
|
|---|
| 86 | void FITS_NTuple::ReadFromFits(FitsInFile& is)
|
|---|
| 87 | {
|
|---|
| 88 | if (!is.IsFitsTable())
|
|---|
| 89 | {
|
|---|
| 90 | throw PException("ReadFromFits: the fits file seems not to be a bintable nor ASCII table");
|
|---|
| 91 | }
|
|---|
| 92 | int nbcols, nbentries;
|
|---|
| 93 | nbcols = is.NbColsFromFits();
|
|---|
| 94 | nbentries = 0;
|
|---|
| 95 | int k;
|
|---|
| 96 | for (k=0; k<nbcols; k++) nbentries=max( nbentries, is.NentriesFromFits(k) );
|
|---|
| 97 |
|
|---|
| 98 | char ** ColName = new char*[nbcols];
|
|---|
| 99 |
|
|---|
| 100 | for (k=0; k<nbcols;k++)
|
|---|
| 101 | {
|
|---|
| 102 | ColName[k] = new char[LONNOM1];
|
|---|
| 103 | strncpy(ColName[k], is.ColNameFromFits(k).c_str(),LONNOM);
|
|---|
| 104 | ColName[k][LONNOM] = '\0';
|
|---|
| 105 | }
|
|---|
| 106 | // Reza Dec 2006 : Colonnes du NTuple de type double par defaut
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|---|
| 107 | for (k=0; k<nbcols;k++)
|
|---|
| 108 | {
|
|---|
| 109 | FitsFile::FitsDataType ss= is.ColTypeFromFits(k);
|
|---|
| 110 | string type;
|
|---|
| 111 | if ( (ss != FitsFile::FitsDataType_double) && (ss != FitsFile::FitsDataType_float) )
|
|---|
| 112 | {
|
|---|
| 113 | if (ss == FitsFile::FitsDataType_int) type= string("integer");
|
|---|
| 114 | else
|
|---|
| 115 | if (ss == FitsFile::FitsDataType_char) type = string("char*");
|
|---|
| 116 | else
|
|---|
| 117 | type = string("unknown");
|
|---|
| 118 | cout << " WARNING: the column " << k << " on fits file is not float but : " << type << endl;
|
|---|
| 119 | }
|
|---|
| 120 | }
|
|---|
| 121 | bool fgdouble = true;
|
|---|
| 122 | if ( is.ColTypeFromFits(0) == FitsFile::FitsDataType_float ) fgdouble = false;
|
|---|
| 123 | if(dobj_ == NULL)
|
|---|
| 124 | {
|
|---|
| 125 | dobj_= new NTuple(nbcols,ColName,512,fgdouble);
|
|---|
| 126 | ownobj_ = true;
|
|---|
| 127 | }
|
|---|
| 128 | else
|
|---|
| 129 | {
|
|---|
| 130 | dobj_->Clean();
|
|---|
| 131 | (*dobj_) = NTuple(nbcols,ColName,512,fgdouble);
|
|---|
| 132 | }
|
|---|
| 133 | for (k=0; k<nbcols;k++)
|
|---|
| 134 | {
|
|---|
| 135 | delete [] ColName[k];
|
|---|
| 136 | }
|
|---|
| 137 | delete [] ColName;
|
|---|
| 138 |
|
|---|
| 139 | // Reza Dec 2006 : Colonnes du NTuple de type double par defaut
|
|---|
| 140 | double* dligne = NULL;
|
|---|
| 141 | float* fligne = NULL;
|
|---|
| 142 | if (fgdouble) dligne = new double[nbcols];
|
|---|
| 143 | else fligne = new float[nbcols];
|
|---|
| 144 |
|
|---|
| 145 | int firstln, lastln;
|
|---|
| 146 | if (numberOfLinesToBeRead_ > 0)
|
|---|
| 147 | {
|
|---|
| 148 | firstln = fistLineToBeRead_;
|
|---|
| 149 | lastln = firstln + numberOfLinesToBeRead_;
|
|---|
| 150 | }
|
|---|
| 151 | else
|
|---|
| 152 | {
|
|---|
| 153 | firstln = 0;
|
|---|
| 154 | lastln = nbentries;
|
|---|
| 155 | }
|
|---|
| 156 | int numLigne;
|
|---|
| 157 | if (fgdouble)
|
|---|
| 158 | for (numLigne=firstln; numLigne < lastln; numLigne++) {
|
|---|
| 159 | is.GetBinTabLine(numLigne, dligne);
|
|---|
| 160 | dobj_->Fill((r_8*)dligne);
|
|---|
| 161 | }
|
|---|
| 162 | else
|
|---|
| 163 | for (numLigne=firstln; numLigne < lastln; numLigne++) {
|
|---|
| 164 | is.GetBinTabLine(numLigne, fligne);
|
|---|
| 165 | dobj_->Fill((r_4*)fligne);
|
|---|
| 166 | }
|
|---|
| 167 |
|
|---|
| 168 | if (dligne) delete [] dligne;
|
|---|
| 169 | if (fligne) delete [] fligne;
|
|---|
| 170 |
|
|---|
| 171 | dobj_->Info()=is.DVListFromFits();
|
|---|
| 172 | }
|
|---|
| 173 |
|
|---|
| 174 | void FITS_NTuple::WriteToFits(FitsOutFile& os)
|
|---|
| 175 | {
|
|---|
| 176 | if(dobj_ == NULL)
|
|---|
| 177 | {
|
|---|
| 178 | cout << " WriteToFits:: dobj_= null " << endl;
|
|---|
| 179 | return;
|
|---|
| 180 | }
|
|---|
| 181 |
|
|---|
| 182 | // table will have 'ncols' columns
|
|---|
| 183 | int ncols = dobj_->NVar();
|
|---|
| 184 |
|
|---|
| 185 | // table will have 'nrows' rows
|
|---|
| 186 | int nentries = dobj_->NEntry();
|
|---|
| 187 |
|
|---|
| 188 | // get names and values from the join DVList object
|
|---|
| 189 | DVList dvl= dobj_->Info();
|
|---|
| 190 | dvl["Content"]= "NTuple";
|
|---|
| 191 | dvl.SetComment("Content", "name of SOPHYA object");
|
|---|
| 192 | dvl["SOPCLSNM"]= "SOPHYA::NTuple";
|
|---|
| 193 | dvl.SetComment("SOPCLSNM", "SOPHYA class name");
|
|---|
| 194 | // extension name
|
|---|
| 195 | // string extname("NTuple_Binary_tbl");
|
|---|
| 196 | string extname = os.NextExtensionName();
|
|---|
| 197 |
|
|---|
| 198 | vector<string> Noms(ncols);
|
|---|
| 199 | int k;
|
|---|
| 200 | for (k=0; k< ncols; k++)
|
|---|
| 201 | {
|
|---|
| 202 | Noms[k]= dobj_->NomIndex(k);
|
|---|
| 203 | }
|
|---|
| 204 |
|
|---|
| 205 | // Gestion NTuple en double ou float / Reza Jan 2006
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|---|
| 206 | if (dobj_->mFgDouble) { // NTuple avec colonnes double
|
|---|
| 207 | string type(ncols, 'D');
|
|---|
| 208 | vector<int> dummy;
|
|---|
| 209 | // Reza 09/2006 : nentries -> 1 pour eviter les colonnes de type vecteur
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|---|
| 210 | os.makeHeaderBntblOnFits(type,Noms, 1, ncols, &dvl, extname, dummy);
|
|---|
| 211 | double* column = new double[nentries];
|
|---|
| 212 | for (k=0; k<ncols;k++)
|
|---|
| 213 | {
|
|---|
| 214 | int j;
|
|---|
| 215 | for(j = 0; j < nentries; j++) column[j]= dobj_->GetCell(j,k);
|
|---|
| 216 | os.PutColToFits(k, nentries, column);
|
|---|
| 217 | }
|
|---|
| 218 | delete [] column;
|
|---|
| 219 | }
|
|---|
| 220 | else { // NTuple avec colonnes float
|
|---|
| 221 | string type(ncols, 'E');
|
|---|
| 222 | vector<int> dummy;
|
|---|
| 223 | // Reza 09/2006 : nentries -> 1 pour eviter les colonnes de type vecteur
|
|---|
| 224 | os.makeHeaderBntblOnFits(type,Noms, 1, ncols, &dvl, extname, dummy);
|
|---|
| 225 | float* column = new float[nentries];
|
|---|
| 226 | for (k=0; k<ncols;k++)
|
|---|
| 227 | {
|
|---|
| 228 | int j;
|
|---|
| 229 | for(j = 0; j < nentries; j++) column[j]= dobj_->GetVal(j,k);
|
|---|
| 230 | os.PutColToFits(k, nentries, column);
|
|---|
| 231 | }
|
|---|
| 232 | delete [] column;
|
|---|
| 233 | }
|
|---|
| 234 | }
|
|---|
| 235 |
|
|---|