| 1 | #include "sopnamsp.h"
 | 
|---|
| 2 | #include "machdefs.h"
 | 
|---|
| 3 | #include "pexceptions.h" 
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|---|
| 4 | #include "fitstarray.h" 
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|---|
| 5 | ///////////////////////////////////////////////////////////
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|---|
| 6 | //   Les objets delegues pour la gestion de persistance sur fichiers fits 
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|---|
| 7 | //    pout TArray
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|---|
| 8 | ///////////////////////////////////////////////////////////
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|---|
| 9 | 
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|---|
| 10 | /*!
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|---|
| 11 |   \class SOPHYA::FITS_TArray
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|---|
| 12 |   \ingroup FitsIOServer
 | 
|---|
| 13 |   FITS format I/O handler for SOPHYA::TArray objects in Sophya.
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|---|
| 14 | */
 | 
|---|
| 15 | 
 | 
|---|
| 16 | using namespace SOPHYA;
 | 
|---|
| 17 | 
 | 
|---|
| 18 | template <class T>
 | 
|---|
| 19 | FITS_TArray<T>::FITS_TArray()
 | 
|---|
| 20 | {
 | 
|---|
| 21 |   dobj_= NULL;
 | 
|---|
| 22 |   ownobj_=false;
 | 
|---|
| 23 | }
 | 
|---|
| 24 | 
 | 
|---|
| 25 | template <class T>
 | 
|---|
| 26 | FITS_TArray<T>::FITS_TArray(char inputfile[],int hdunum)
 | 
|---|
| 27 | {
 | 
|---|
| 28 |   dobj_=NULL;
 | 
|---|
| 29 |   ownobj_=false; 
 | 
|---|
| 30 |   Read(inputfile,hdunum);
 | 
|---|
| 31 | }
 | 
|---|
| 32 | 
 | 
|---|
| 33 | template <class T>
 | 
|---|
| 34 | FITS_TArray<T>::FITS_TArray(const TArray<T> & obj) 
 | 
|---|
| 35 | { 
 | 
|---|
| 36 |     dobj_ = new TArray<T>(obj);
 | 
|---|
| 37 |   ownobj_=true; 
 | 
|---|
| 38 | }
 | 
|---|
| 39 | 
 | 
|---|
| 40 | template <class T>
 | 
|---|
| 41 | FITS_TArray<T>::FITS_TArray(TArray<T> *obj) 
 | 
|---|
| 42 | { 
 | 
|---|
| 43 |   dobj_ = obj;
 | 
|---|
| 44 |   ownobj_=false; 
 | 
|---|
| 45 | }
 | 
|---|
| 46 | 
 | 
|---|
| 47 | 
 | 
|---|
| 48 | template <class T>
 | 
|---|
| 49 | FITS_TArray<T>::~FITS_TArray()
 | 
|---|
| 50 | {
 | 
|---|
| 51 |   if (ownobj_ && dobj_) delete dobj_;
 | 
|---|
| 52 | }
 | 
|---|
| 53 | 
 | 
|---|
| 54 | 
 | 
|---|
| 55 | template <class T>
 | 
|---|
| 56 | AnyDataObj* FITS_TArray<T>::DataObj()
 | 
|---|
| 57 | {
 | 
|---|
| 58 |   return(dobj_);
 | 
|---|
| 59 | }
 | 
|---|
| 60 | 
 | 
|---|
| 61 | 
 | 
|---|
| 62 | template <class T>
 | 
|---|
| 63 | void   FITS_TArray<T>::SetDataObj(AnyDataObj & o) 
 | 
|---|
| 64 |   {   
 | 
|---|
| 65 |     TArray<T>* po = dynamic_cast<  TArray<T>* >(& o); 
 | 
|---|
| 66 |     if (po == NULL) return;
 | 
|---|
| 67 |     if (ownobj_ && dobj_) delete dobj_;  
 | 
|---|
| 68 |     dobj_ = po; 
 | 
|---|
| 69 |     ownobj_ = false; 
 | 
|---|
| 70 |   }    
 | 
|---|
| 71 | 
 | 
|---|
| 72 | 
 | 
|---|
| 73 | 
 | 
|---|
| 74 | template <class T>
 | 
|---|
| 75 | void FITS_TArray<T>::ReadFromFits(FitsInFile& is)
 | 
|---|
| 76 | {
 | 
|---|
| 77 |   if (!is.IsFitsImage())
 | 
|---|
| 78 |     {
 | 
|---|
| 79 |       throw PException("ReadFromFits: the fits file seems not to be an image");
 | 
|---|
| 80 |     }
 | 
|---|
| 81 |   int dimension = is.nbDimOfImage();
 | 
|---|
| 82 |   sa_size_t * siz = new sa_size_t[dimension];
 | 
|---|
| 83 |   for (int k=0; k< dimension; k++) siz[k] = is.dimOfImageAxes()[k];
 | 
|---|
| 84 |   if(dobj_ == NULL)
 | 
|---|
| 85 |     {
 | 
|---|
| 86 |       dobj_ = new TArray<T>(dimension,siz);
 | 
|---|
| 87 |       ownobj_ = true;
 | 
|---|
| 88 |     }
 | 
|---|
| 89 |   else
 | 
|---|
| 90 |     dobj_->ReSize(dimension,siz);
 | 
|---|
| 91 |   
 | 
|---|
| 92 |   delete [] siz;
 | 
|---|
| 93 |   if (dobj_->Size() != is.nbOfImageData() )
 | 
|---|
| 94 |   {
 | 
|---|
| 95 |     cout << " total size of TArray: " << dobj_->Size() << endl;
 | 
|---|
| 96 |     cout << " total size from fits file: " << is.nbOfImageData() << endl;
 | 
|---|
| 97 |       throw PException("ReadFromFits: size conflict");
 | 
|---|
| 98 |   }
 | 
|---|
| 99 |   // On lit le tableau
 | 
|---|
| 100 |   is.GetSingleColumn( dobj_->Data(),dobj_->Size());
 | 
|---|
| 101 |     dobj_->Info()  = is.DVListFromFits();
 | 
|---|
| 102 | 
 | 
|---|
| 103 | }
 | 
|---|
| 104 | 
 | 
|---|
| 105 | 
 | 
|---|
| 106 | template <class T>
 | 
|---|
| 107 | void FITS_TArray<T>::WriteToFits(FitsOutFile& os)  
 | 
|---|
| 108 | {
 | 
|---|
| 109 |   if(dobj_ == NULL) return;
 | 
|---|
| 110 |   uint_4 nbdim = dobj_->NbDimensions();
 | 
|---|
| 111 |   if ( nbdim == 0) 
 | 
|---|
| 112 |     {
 | 
|---|
| 113 |       throw PException(" FITS_TARRAY: number of dimensions of the array = 0?");
 | 
|---|
| 114 |     }
 | 
|---|
| 115 |   //cout << "FITS_TARRAY: nombre de dimension du tableau a ecrire: " << nbdim << endl;
 | 
|---|
| 116 |   int* naxisn = new int[nbdim];
 | 
|---|
| 117 |   int k;
 | 
|---|
| 118 |   for (k=0; k< nbdim; k++)
 | 
|---|
| 119 |     {
 | 
|---|
| 120 |       naxisn[k] = dobj_->Size(k);
 | 
|---|
| 121 |      // cout << " nombre de donnees dans la la dimension " << k << " : " << naxisn[k] << endl;
 | 
|---|
| 122 |     }
 | 
|---|
| 123 |   char type;
 | 
|---|
| 124 |   if ( typeid(T) == typeid(r_8) ) type='D';
 | 
|---|
| 125 |   else 
 | 
|---|
| 126 |     if ( typeid(T) == typeid(r_4) )  type='E';
 | 
|---|
| 127 |     else
 | 
|---|
| 128 |       if ( typeid(T) == typeid(int_4) )  type='J';
 | 
|---|
| 129 |       else
 | 
|---|
| 130 |         {
 | 
|---|
| 131 |           cout <<  " type du tableau= " <<  typeid(T).name() << endl;
 | 
|---|
| 132 |           throw IOExc("FITS_TArray:: unknown type");
 | 
|---|
| 133 |         }
 | 
|---|
| 134 | 
 | 
|---|
| 135 |   int nbels = 1;
 | 
|---|
| 136 |   for (k=0; k< nbdim; k++) 
 | 
|---|
| 137 |     {
 | 
|---|
| 138 |       if (naxisn[k] > 0) nbels *= naxisn[k];
 | 
|---|
| 139 |     }
 | 
|---|
| 140 |  // cout << " nombre total d'elements a copier " << nbels << endl;
 | 
|---|
| 141 |   DVList dvl( dobj_->Info() );  
 | 
|---|
| 142 |   dvl["Content"]= "TArray";
 | 
|---|
| 143 |   dvl.SetComment("Content", "name of SOPHYA object");
 | 
|---|
| 144 |   os.makeHeaderImageOnFits(type, nbdim, naxisn, &dvl);
 | 
|---|
| 145 |   if (!dobj_->IsPacked()) 
 | 
|---|
| 146 |     {
 | 
|---|
| 147 |       cout << " IsPacked() = " << dobj_->IsPacked() << endl;
 | 
|---|
| 148 |       throw PException(" FITS_TARRAY: this case is not yet programmed");
 | 
|---|
| 149 |       
 | 
|---|
| 150 |     }
 | 
|---|
| 151 |   if (dobj_->MinStep() != 1) 
 | 
|---|
| 152 |     {
 | 
|---|
| 153 |       cout << " MinStep()) = " << dobj_->MinStep() << endl;
 | 
|---|
| 154 |       throw PException(" FITS_TARRAY: this case is not yet programmed");
 | 
|---|
| 155 |       
 | 
|---|
| 156 |     }
 | 
|---|
| 157 |   os.PutImageToFits(nbels, dobj_->Data());
 | 
|---|
| 158 |   
 | 
|---|
| 159 |   delete [] naxisn;
 | 
|---|
| 160 | }
 | 
|---|
| 161 | 
 | 
|---|
| 162 | 
 | 
|---|
| 163 | #ifdef __CXX_PRAGMA_TEMPLATES__
 | 
|---|
| 164 | #pragma define_template FITS_TArray<r_8>
 | 
|---|
| 165 | #pragma define_template FITS_TArray<r_4>
 | 
|---|
| 166 | #pragma define_template FITS_TArray<int_4>
 | 
|---|
| 167 | #endif
 | 
|---|
| 168 | #if defined(ANSI_TEMPLATES) || defined(GNU_TEMPLATES)
 | 
|---|
| 169 | namespace SOPHYA {
 | 
|---|
| 170 | template class FITS_TArray<r_8>;
 | 
|---|
| 171 | template class FITS_TArray<r_4>;
 | 
|---|
| 172 | template class FITS_TArray<int_4>;
 | 
|---|
| 173 | }
 | 
|---|
| 174 | #endif
 | 
|---|