| 1 | #include "sopnamsp.h"
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| 2 | #include "machdefs.h"
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| 3 | #include "pexceptions.h"
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| 4 | #include "fitstarray.h"
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| 5 | ///////////////////////////////////////////////////////////
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| 6 | // Les objets delegues pour la gestion de persistance sur fichiers fits
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| 7 | // pout TArray
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| 8 | ///////////////////////////////////////////////////////////
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| 9 |
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| 10 | /*!
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| 11 | \class SOPHYA::FITS_TArray
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| 12 | \ingroup FitsIOServer
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| 13 | FITS format I/O handler for SOPHYA::TArray objects in Sophya.
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| 14 | */
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| 15 |
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|---|
| 16 | using namespace SOPHYA;
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| 17 |
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|---|
| 18 | template <class T>
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|---|
| 19 | FITS_TArray<T>::FITS_TArray()
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|---|
| 20 | {
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|---|
| 21 | dobj_= NULL;
|
|---|
| 22 | ownobj_=false;
|
|---|
| 23 | }
|
|---|
| 24 |
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|---|
| 25 | template <class T>
|
|---|
| 26 | FITS_TArray<T>::FITS_TArray(const char inputfile[],int hdunum)
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|---|
| 27 | {
|
|---|
| 28 | dobj_=NULL;
|
|---|
| 29 | ownobj_=false;
|
|---|
| 30 | Read(inputfile,hdunum);
|
|---|
| 31 | }
|
|---|
| 32 |
|
|---|
| 33 | template <class T>
|
|---|
| 34 | FITS_TArray<T>::FITS_TArray(const TArray<T> & obj)
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|---|
| 35 | {
|
|---|
| 36 | dobj_ = new TArray<T>(obj);
|
|---|
| 37 | ownobj_=true;
|
|---|
| 38 | }
|
|---|
| 39 |
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|---|
| 40 | template <class T>
|
|---|
| 41 | FITS_TArray<T>::FITS_TArray(TArray<T> *obj)
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|---|
| 42 | {
|
|---|
| 43 | dobj_ = obj;
|
|---|
| 44 | ownobj_=false;
|
|---|
| 45 | }
|
|---|
| 46 |
|
|---|
| 47 |
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|---|
| 48 | template <class T>
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|---|
| 49 | FITS_TArray<T>::~FITS_TArray()
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|---|
| 50 | {
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|---|
| 51 | if (ownobj_ && dobj_) delete dobj_;
|
|---|
| 52 | }
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|---|
| 53 |
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|---|
| 54 |
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|---|
| 55 | template <class T>
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|---|
| 56 | AnyDataObj* FITS_TArray<T>::DataObj()
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|---|
| 57 | {
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|---|
| 58 | return(dobj_);
|
|---|
| 59 | }
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|---|
| 60 |
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|---|
| 61 |
|
|---|
| 62 | template <class T>
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|---|
| 63 | void FITS_TArray<T>::SetDataObj(AnyDataObj & o)
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|---|
| 64 | {
|
|---|
| 65 | TArray<T>* po = dynamic_cast< TArray<T>* >(& o);
|
|---|
| 66 | if (po == NULL) return;
|
|---|
| 67 | if (ownobj_ && dobj_) delete dobj_;
|
|---|
| 68 | dobj_ = po;
|
|---|
| 69 | ownobj_ = false;
|
|---|
| 70 | }
|
|---|
| 71 |
|
|---|
| 72 |
|
|---|
| 73 |
|
|---|
| 74 | template <class T>
|
|---|
| 75 | void FITS_TArray<T>::ReadFromFits(FitsInFile& is)
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|---|
| 76 | {
|
|---|
| 77 | if (!is.IsFitsImage())
|
|---|
| 78 | {
|
|---|
| 79 | throw PException("ReadFromFits: the fits file seems not to be an image");
|
|---|
| 80 | }
|
|---|
| 81 | int dimension = is.nbDimOfImage();
|
|---|
| 82 | sa_size_t * siz = new sa_size_t[dimension];
|
|---|
| 83 | for (int k=0; k< dimension; k++) siz[k] = is.dimOfImageAxes()[k];
|
|---|
| 84 | if(dobj_ == NULL)
|
|---|
| 85 | {
|
|---|
| 86 | dobj_ = new TArray<T>(dimension,siz);
|
|---|
| 87 | ownobj_ = true;
|
|---|
| 88 | }
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|---|
| 89 | else
|
|---|
| 90 | dobj_->ReSize(dimension,siz);
|
|---|
| 91 |
|
|---|
| 92 | delete [] siz;
|
|---|
| 93 | if (dobj_->Size() != is.nbOfImageData() )
|
|---|
| 94 | {
|
|---|
| 95 | cout << " total size of TArray: " << dobj_->Size() << endl;
|
|---|
| 96 | cout << " total size from fits file: " << is.nbOfImageData() << endl;
|
|---|
| 97 | throw PException("ReadFromFits: size conflict");
|
|---|
| 98 | }
|
|---|
| 99 | // On lit le tableau
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|---|
| 100 | is.GetSingleColumn( dobj_->Data(),dobj_->Size());
|
|---|
| 101 | dobj_->Info() = is.DVListFromFits();
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|---|
| 102 |
|
|---|
| 103 | }
|
|---|
| 104 |
|
|---|
| 105 |
|
|---|
| 106 | template <class T>
|
|---|
| 107 | void FITS_TArray<T>::WriteToFits(FitsOutFile& os)
|
|---|
| 108 | {
|
|---|
| 109 | if(dobj_ == NULL) return;
|
|---|
| 110 | uint_4 nbdim = dobj_->NbDimensions();
|
|---|
| 111 | if ( nbdim == 0)
|
|---|
| 112 | {
|
|---|
| 113 | throw PException(" FITS_TARRAY: number of dimensions of the array = 0?");
|
|---|
| 114 | }
|
|---|
| 115 | //cout << "FITS_TARRAY: nombre de dimension du tableau a ecrire: " << nbdim << endl;
|
|---|
| 116 | int* naxisn = new int[nbdim];
|
|---|
| 117 | int k;
|
|---|
| 118 | for (k=0; k< nbdim; k++)
|
|---|
| 119 | {
|
|---|
| 120 | naxisn[k] = dobj_->Size(k);
|
|---|
| 121 | // cout << " nombre de donnees dans la la dimension " << k << " : " << naxisn[k] << endl;
|
|---|
| 122 | }
|
|---|
| 123 | char type;
|
|---|
| 124 | if ( typeid(T) == typeid(r_8) ) type='D';
|
|---|
| 125 | else
|
|---|
| 126 | if ( typeid(T) == typeid(r_4) ) type='E';
|
|---|
| 127 | else
|
|---|
| 128 | if ( typeid(T) == typeid(int_4) ) type='J';
|
|---|
| 129 | else
|
|---|
| 130 | {
|
|---|
| 131 | cout << " type du tableau= " << typeid(T).name() << endl;
|
|---|
| 132 | throw IOExc("FITS_TArray:: unknown type");
|
|---|
| 133 | }
|
|---|
| 134 |
|
|---|
| 135 | int nbels = 1;
|
|---|
| 136 | for (k=0; k< nbdim; k++)
|
|---|
| 137 | {
|
|---|
| 138 | if (naxisn[k] > 0) nbels *= naxisn[k];
|
|---|
| 139 | }
|
|---|
| 140 | // cout << " nombre total d'elements a copier " << nbels << endl;
|
|---|
| 141 | DVList dvl( dobj_->Info() );
|
|---|
| 142 | dvl["Content"]= "TArray";
|
|---|
| 143 | dvl.SetComment("Content", "name of SOPHYA object");
|
|---|
| 144 | os.makeHeaderImageOnFits(type, nbdim, naxisn, &dvl);
|
|---|
| 145 | if (!dobj_->IsPacked())
|
|---|
| 146 | {
|
|---|
| 147 | cout << " IsPacked() = " << dobj_->IsPacked() << endl;
|
|---|
| 148 | throw PException(" FITS_TARRAY: this case is not yet programmed");
|
|---|
| 149 |
|
|---|
| 150 | }
|
|---|
| 151 | if (dobj_->MinStep() != 1)
|
|---|
| 152 | {
|
|---|
| 153 | cout << " MinStep()) = " << dobj_->MinStep() << endl;
|
|---|
| 154 | throw PException(" FITS_TARRAY: this case is not yet programmed");
|
|---|
| 155 |
|
|---|
| 156 | }
|
|---|
| 157 | os.PutImageToFits(nbels, dobj_->Data());
|
|---|
| 158 |
|
|---|
| 159 | delete [] naxisn;
|
|---|
| 160 | }
|
|---|
| 161 |
|
|---|
| 162 |
|
|---|
| 163 | #ifdef __CXX_PRAGMA_TEMPLATES__
|
|---|
| 164 | #pragma define_template FITS_TArray<r_8>
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|---|
| 165 | #pragma define_template FITS_TArray<r_4>
|
|---|
| 166 | #pragma define_template FITS_TArray<int_4>
|
|---|
| 167 | #endif
|
|---|
| 168 | #if defined(ANSI_TEMPLATES) || defined(GNU_TEMPLATES)
|
|---|
| 169 | namespace SOPHYA {
|
|---|
| 170 | template class FITS_TArray<r_8>;
|
|---|
| 171 | template class FITS_TArray<r_4>;
|
|---|
| 172 | template class FITS_TArray<int_4>;
|
|---|
| 173 | }
|
|---|
| 174 | #endif
|
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